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J-GLOBAL ID：202202215835379700   整理番号：22A0838254

SARS-CoV-2のゲノム特性化と臨床転帰との関連:コロンビアにおけるパンデミックの1年間の縦断的研究【JST・京大機械翻訳】

Genomic characterization of SARS-CoV-2 and its association with clinical outcomes: a 1-year longitudinal study of the pandemic in Colombia

著者 (13件)： Ruiz-Sternberg Angela Maria (Clinical Investigation Group, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Chaparro-Solano Henry Mauricio (Clinical Investigation Group, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Chaparro-Solano Henry Mauricio (Genuino Research Group, Gencell Pharma, Bogota, Colombia) ,  Chaparro-Solano Henry Mauricio (Hospital Universitario Mayor - Mederi, Bogota, Colombia) ,  Albornoz Ludwig L. (Departamento de Patologia y Medicina de Laboratorio, Fundacion Valle del Lili, Cali, Colombia) ,  Albornoz Ludwig L. (Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad ICESI, Cali, Colombia) ,  Pinzon-Rondon Angela Maria (Clinical Investigation Group, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Pardo-Oviedo Juan Mauricio (Clinical Investigation Group, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Pardo-Oviedo Juan Mauricio (Hospital Universitario Mayor - Mederi, Bogota, Colombia) ,  Molano-Gonzalez Nicolas (Clinical Investigation Group, Universidad del Rosario, Bogota, Colombia) ,  Otero-Rodriguez Diego Andres (Genuino Research Group, Gencell Pharma, Bogota, Colombia) ,  Zapata-Gomez Fabio Andres (Genuino Research Group, Gencell Pharma, Bogota, Colombia) ,  Galvez Jubby Marcela (Genuino Research Group, Gencell Pharma, Bogota, Colombia)
資料名： International Journal of Infectious Diseases  (International Journal of Infectious Diseases)
巻： 116  ページ： 91-100  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3271A  ISSN： 1201-9712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,コロナウイルス病2019の流行の最初の1年間の2つの主なコロンビアエピセントにおける,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス-2(SARS-CoV-2)と疾患重症度の分子的特性化の間の関連を探求することを目的とした。全体で,SARS-CoV-2感染の1000人の患者を本研究に含めた。臨床データを997人の患者から収集し,678の全ゲノム配列を大規模並列配列決定により得た。二変量,多変量,および分類と回帰木分析を,臨床とゲノム変数の間で実行した。年齢>88歳,および系統B.1.1,B.1.1.388,B.1.523またはB.1.621の71~88歳の患者に対する感染は,死亡と関連していた(オッズ比(OR)6.048036,95%信頼区間(CI)1.346567~32.92521;P=0.01718674)。入院の必要性は,より高い年齢と共存症と関連していた。入院率は,系統A,B,B.1.1.388,B.1.1.434,B.1.153,B.1.36.10,B.1.411,B.1.471,B.1.558またはB.1.621(OR8.368427,95%CI2.573145-39.10672,P=0.00012)で感染した38-51歳の患者に対して有意に増加した。”B.1.1.11,B.1.1.1.13,B.1.36.10,B.1.411,B.1.471,B.1.558またはB.1.621(OR8.368427,95%CI 2.573145-39.10672,P=0.00012)。クレードと臨床結果の間の関係は,以前に報告されたデータから分岐した。系統B.1.621による感染は,入院と死亡率を増加させた。これらの知見は,コロンビアおよび他の国々における急速に増加する罹患率に加えて,系統B.1.621が,関心の「変として考慮されるべきであることを示唆する。関連する疾患重症度が確認されるならば,懸念の「変としての可能な設計を考慮すべきである。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 死亡率 ,  ヌクレオチド配列 ,  ウイルス感染症 ,  コロンビア共和国 ,  *ゲノム ,  感染 ,  *コロナウイルス科 ,  キャラクタリゼーション ,  呼吸器感染症
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  重症急性呼吸器症候群 ,  共存罹患 ,  臨床データ ,  ゲノム配列 ,  クレード ,  重症度 ,  多変量 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  SARS-CoV-2変異体 ,  COVID-19 ,  死亡率 ,  入院 ,  ハイスループットヌクレオチド配列決定

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (7件)： SARS-CoV-2 ,  ゲノム ,  特性化 ,  臨床転帰 ,  コロンビア ,  パンデミック ,  研究