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J-GLOBAL ID：202202215852262384   整理番号：22A0828107

カンジダ・アルビカンスに対する標的ベース薬物再浄化-計算モデリング,ドッキング,および分子動力学シミュレーション研究【JST・京大機械翻訳】

Target-based drug repurposing against Candida albicans-A computational modeling, docking, and molecular dynamic simulations study

著者 (7件)： Verma Rashi (Department of Biosciences, Jamia Millia Islamia, New Delhi, India) ,  Verma Rashi (Biomedical Informatics Centre, Indian Council of Medical Research, New Delhi, India) ,  Pradhan Dibyabhaba (Computational Genomics Centre, All India Institute of Medical Sciences, Indian Council of Medical Research, New Delhi, India) ,  Nayek Arnab (Department of Biochemistry, All India Institute of Medical Sciences, New Delhi, India) ,  Singh Harpreet (Computational Genomics Centre, All India Institute of Medical Sciences, Indian Council of Medical Research, New Delhi, India) ,  Jain Arun Kumar (Biomedical Informatics Centre, Indian Council of Medical Research, New Delhi, India) ,  Khan Luqman Ahmad (Department of Biosciences, Jamia Millia Islamia, New Delhi, India)
資料名： Journal of Cellular Biochemistry  (Journal of Cellular Biochemistry)
巻： 123  号： 2  ページ： 289-305  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0326B  ISSN： 0730-2312  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Candida albicansの多剤耐性株の出現は,主に侵襲性カンジダ症につながる免疫合併患者による共感染による世界的な脅威となっている。病気の生命を脅かす形態は,薬物再精製によって迅速かつ効果的に管理することができる。したがって,本研究は3つの薬物標的-TRR1,TOM40,およびYHB1に対する食品医薬品局(FDA)承認薬を評価するためのin silicoアプローチを用いた。3つの薬物標的の三次構造をモデル化し,精密化し,PROCHECK,ERRATおよびPROSAに基づく構造健全性を評価した。FDA承認薬(8815),相互作用分析,およびエネルギープロファイルのハイスループット仮想スクリーニングは,DB01102(アルブタミン),DB01611(ヒドロキシクロロキン),およびDB09319(カリンダシリン)が,それぞれ,TRR1,TOM40,およびYHB1とのより良い結合親和性を示したことを明らかにした。”その結論]。”結論],DB01102(アルブタミン),DB01611(ヒドロキシクロロキン),およびDB09319(カリンダシリン)は,それぞれ,TRR1,TOM40,およびYHB1とより良い結合親和性を示した。特に,分子動力学シミュレーションは,TRR1のGln45,Thr119,およびAsp288を探査した。TOM40のThr107とSer121;YHB1のArg193,Glu213,およびSer228は,安定な薬物標的相互作用のための重要な残基である。さらに,それはまた,MM-PBSA(-52.72kcal/mol),RMSD(2.43Å),および回転半径(-21.49Å)に基づく最良の薬物標的複合体として,アルブタミン-TRR1を優先した。詳細なPCA結果は分子動力学シミュレーションの知見を支持した。興味深いことに,病原性Candida種由来のTRR1配列間の保存領域(>70%)はCandidaの多重種に対するアルブタミンの有効性を示した。したがって,本研究は,C.albicansに対する潜在的抗真菌剤を考慮するための高度な技術の開発の理解を深め,理解を深める。それにもかかわらず,生命を脅かすカンジダ症に対するアルブタミンの有効性を調べるために,詳細な実験的検証が必要である。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *計算機シミュレーション ,  抗真菌薬 ,  *モデリング ,  多重化 ,  複合体 ,  鵞口瘡カンジダ ,  カンジダ症 ,  親和性 ,  慣性半径 ,  多剤耐性
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  in silico ,  *分子動力学シミュレーション ,  ハイスループット ,  バーチャルスクリーニング ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 抗真菌耐性 ,  カンジダ症 ,  薬物の再利用 ,  構造ベースドラッグデザイン ,  毒性因子

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 標的 ,  薬物 ,  浄化 ,  計算モデリング ,  ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  研究