文献

J-GLOBAL ID：202202216401990627   整理番号：22A0725589

リジン反応性プロファイリングによる薬物標的と結合部位のプロテオームワイドデコンボリューション【JST・京大機械翻訳】

Proteome-Wide Deconvolution of Drug Targets and Binding Sites by Lysine Reactivity Profiling

著者 (12件)： Ruan Chengfei (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Ruan Chengfei (University of Chinese Academy of Sciences, China) ,  Zhou Jiahua (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Zhou Jiahua (University of Chinese Academy of Sciences, China) ,  Li Zhouxian (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Li Zhouxian (Shanghai Key Laboratory of Functional Materials Chemistry, Department of Chemistry and Molecular Engineering, East China University of Science and Technology, China) ,  Li Kejia (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Li Kejia (University of Chinese Academy of Sciences, China) ,  Fang Zheng (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Fang Zheng (University of Chinese Academy of Sciences, China) ,  Zhang Xiaolei (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China) ,  Ye Mingliang (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences (CAS), China)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 94  号： 7  ページ： 3352-3359  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,複雑なプロテオームにおける薬物標的と結合部位の同定に多くの努力が払われており,それは現代の薬物発見において非常に重要である。本研究では,プロテオームレベルでの薬物結合標的と結合部位を系統的に研究するためのロバストなリジン反応性プロファイリング法を開発した。この方法は,標的蛋白質の特異的領域への薬物の結合が,この領域に位置するリジン残基の反応性を変化させ,これらの変化が濃縮可能およびリジン反応性プローブで検出できるという原理に基づいている。データ非依存性取得(DIA)と連結して,既知標的蛋白質及び対応する結合部位を3モデル薬物:ゲルダナマイシン,スタウロスポリン及びダサチニブに対するK562細胞溶解物から成功裏に明らかにした。さらに,スタウロスポリンのスクリーニング中の本法により,特定の標的の薬物誘導配座転移も明らかになった。スタウロスポリンとダサチニブのスクリーニングから明らかにされた著者らの方法のスクリーニング感度は,熱プロテオームプロファイリング(TPP)または機械学習に基づく制限蛋白質分解(LiP-Quant)のそれに匹敵した。全体として,アデノシン5′-三リン酸(ATP)結合標的を含む21および4キナーゼ標的を,それぞれK562細胞溶解物中のスタウロスポリンおよびダサチニブに対して同定した。TPP,LiP-Quant,および著者らの方法によって同定した標的蛋白質は相補的であり,蛋白質の異なる性質を調べる新しい方法の開発は,薬物標的デコンボリューションにおいて非常に重要であることを見出した。また,リジン反応性変化を含むプロテオームワイドプロービング多重事象における著者らの方法のさらなる応用を展望した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 配座転移 ,  タンパク質 ,  *デコンボリューション ,  多重化 ,  *結合部位 ,  モデル ,  スクリーニング ,  ロバスト性 ,  機械学習 ,  *プロテオーム ,  エーテル ,  ラクタム ,  酸素複素環化合物 ,  架橋化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  第二アミン ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 標的蛋白質 ,  キナーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  質量分析  (CC03013N)

物質索引 (3件)： ダサチニブ ,  スタウロスポリン ,  リジン

タイトルに関連する用語 (5件)： リジン ,  反応性 ,  プロファイリング ,  薬物標的 ,  結合部位