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J-GLOBAL ID：202202216910415893   整理番号：22A0477841

ゲノムワイド環状RNA(circRNA)とmRNAプロファイリングは結腸直腸癌における細胞増殖のためのcircMET-miR-410-3p調節モチーフを同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide circular RNA (circRNA) and mRNA profiling identify a circMET-miR-410-3p regulatory motif for cell growth in colorectal cancer

著者 (12件)： Liu Yining (The School of Public Health, Institute for Chemical Carcinogenesis, Guangzhou Medical University, Guangzhou, PR China) ,  Chen Lei (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Liu Tianqi (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Su Xiangqian (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Peng Lin (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Chen Jiangbo (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Tan Fei (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Xing Pu (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Wang Zaozao (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Di Jiabo (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Jiang Beihai (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing 100142, PR China) ,  Qu Hong (Center for Bioinformatics, State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, School of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, PR China)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 114  号： 1  ページ： 351-360  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 円形RNA(circRNA)は,ポリアデニル化尾部を欠く非コードRNA分子であり,ヒト細胞で高度に安定であり,豊富で保存されている。CircRNAは,スポンジマイクロRNA(miRNA)に対する競合内因性RNA(ceRNA)として機能し,標的mRNA発現に対するそれらの効果を遮断する。CircRNAはまた癌への関連性があり,従って癌の進行を監視するための理想的なバイオマーカーと考えられる。約300,000の予測ヒト循環RNAのうち,癌に関連する生物学的機能を検証した。結腸直腸癌(CRC)におけるサーコRNAのceRNA役割をより良く理解するために,著者らは9つのCRC腫瘍サンプルとそれらの対組織学的に正常な隣接組織サンプルに関してゲノムワイドサーコRNAベースのRNA配列(RNA-Seq)を実行した。同じ患者におけるmRNA発現をプロファイリングすることによって,著者らはさらに,同じ親遺伝子から作り出されるサーコRNAとmRNAの間の発現相関を調査した。サーコRNAとmRNA間の調和的差次的発現に焦点を合わせて,調節ノイズを実質的に減少させた。全体で,腫瘍と正常組織の間で一貫して,または下方制御された694のcircRNA-mRNA対を同定した。これらの694circRNA-mRNA対はホルモン応答と走化性に関連する182の蛋白質コード遺伝子である。これらの182遺伝子のうち,43は3つの高度に保存されたmiRNA(miR-410-3p,miR-135aおよびmiR-30a)の下流標的である。興味深いことに,これらの43の遺伝子は8つの独立したCRC研究から別のコホートで高度に変異しており,患者の生存時間に著しい影響を及ぼす。miR-410-3pとその標的癌遺伝子METに焦点を当てて,著者らは,サークルMETのceRNA調節モチーフを実験的に検証した。特に,循環METはCRC細胞株で実質的にアップレギュレートされ,細胞増殖と増殖を促進する。miR-410-3pと循環METの間の調節関係を確認することによって,著者らはCRCにおけるMETの持続的活性化を観察した新しい機構を提案する。結論として,著者らの研究は循環METの新しい調節的役割を同定し,CRCに対する潜在的診断バイオマーカーを提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  腫瘍 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  *細胞増殖 ,  生物活性 ,  癌遺伝子 ,  ダウンレギュレーション ,  ポリアデニル化 ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： 細胞株 ,  マイクロRNA ,  *結腸直腸癌 ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 環状RNA ,  MET ,  競合する内因性RNA ,  癌生物学

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  生物学的機能  (EB04020F)

タイトルに関連する用語 (11件)： ゲノム ,  環状RNA ,  circRNA ,  mRNA ,  プロファイリング ,  結腸直腸癌 ,  細胞増殖 ,  MIR ,  調節 ,  モチーフ ,  同定