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J-GLOBAL ID：202202218097759650   整理番号：22A0156928

比較完全長トランスクリプトーム解析はTaraxacum kok-saghyz rodin根における天然ゴム生合成の調節機構への新規洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Comparative full-length transcriptome analysis provides novel insights into the regulatory mechanism of natural rubber biosynthesis in Taraxacum kok-saghyz Rodin roots

著者 (7件)： Yang Yushuang (Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Haikou 571101, PR China) ,  Qin Bi (Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Haikou 571101, PR China) ,  Chen Qiuhui (Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Haikou 571101, PR China) ,  Zhang Jichuan (College of Materials Science and Engineering, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, PR China) ,  Zhang Liqun (College of Materials Science and Engineering, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, PR China) ,  Nie Qiuhai (Beijing Linglong Dandelion Technology and Development Ltd, Beijing, 101102, Beijing, PR China) ,  Liu Shizhong (Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Haikou 571101, PR China)
資料名： Industrial Crops and Products  (Industrial Crops and Products)
巻： 175  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0732A  ISSN： 0926-6690  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Taaxacum kok-saghyz Rodin(TKS)は,その根で合成される高品質天然ゴム(NR)による有望な代替ゴム生産植物である。それにもかかわらず,TKS根におけるNR生合成の包括的な分子機構は,分割され,分かりにくいままである。本研究では,転写レベルでのNR合成の調節機構を解明するために,TKSの高品質完全長根トランスクリプトームデータをOxfordナノポア技術(ONT)に基づいて作成した。オルタナティブスプライシング事象,ポリアデニル化部位および単純配列反復(SSR)を有する転写物をスクリーニングした。次に,比較トランスクリプトーム解析を,高ゴム(HR)と低ゴム(LR)含有量を含む系統の間で行い,合計3134の差次的発現遺伝子(DEG)を同定した。遺伝子の中で,1157のDEGがアップレギュレートされ,1977のDEGがHR系統対LR系統でダウンレギュレートされた。NR合成に関与する遺伝子はHR系統でアップレギュレートされた。対照的に,NR生合成として同じ基質(イソペンテニルピロリン酸またはアセチルCoA)を必要とする,スクアレン,フェニルプロパノイド,脂肪酸およびケトンの合成に関与する重要な遺伝子は,HR系統でダウンレギュレートされた。結果は,NR合成関連遺伝子の発現レベルがNR産生に比例し,NRといくつかの代謝産物合成の間の競合が一般的基質を用いたときに存在することを示した。したがって,本研究は,TKSにおけるNR生合成の調節機構への新しい洞察を提供する。さらに,本研究で同定されたNR合成に関連する遺伝子または経路は,さらに遺伝的修飾および分子育種のための重要な標的であろう。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *天然ゴム ,  *生合成 ,  ケトン ,  脂肪酸 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  代謝産物 ,  選択的スプライシング ,  *タンポポ属 ,  ポリアデニル化 ,  *トランスクリプトーム ,  ポリエン ,  鎖状トリテルペン
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  フェニルプロパノイド ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Taraxacum kok-saghyzロジン ,  根 ,  完全長トランスクリプトーム ,  天然ゴムの生合成 ,  差次的発現遺伝子 ,  オックスフォードナノ細孔技術

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  特用作物一般  (FC03071W)

物質索引 (1件)： スクアレン

タイトルに関連する用語 (7件)： トランスクリプトーム解析 ,  Taraxacum ,  根 ,  天然ゴム ,  生合成 ,  調節 ,  洞察