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J-GLOBAL ID：202202218171335074   整理番号：22A0411443

Microcoleus(藍藻類)は個体群構造に強い勾配を持たない流域全体集団を形成する【JST・京大機械翻訳】

Microcoleus (Cyanobacteria) form watershed-wide populations without strong gradients in population structure

著者 (9件)： Bouma-Gregson Keith (Office of Information Management and Analysis, State Water Resources Control Board, Sacramento, California, USA) ,  Bouma-Gregson Keith (Earth and Planetary Science Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Crits-Christoph Alexander (Plant and Microbial Ecology Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Olm Mathew R. (Plant and Microbial Ecology Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Power Mary E. (Integrative Biology Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Banfield Jillian F. (Earth and Planetary Science Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Banfield Jillian F. (Plant and Microbial Ecology Department, University of California, Berkeley, California, USA) ,  Banfield Jillian F. (Earth Sciences Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, California, USA) ,  Banfield Jillian F. (Chan Zuckerberg Biohub, San Francisco, California, USA)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 31  号： 1  ページ： 86-103  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 距離による分離と個体群遺伝的多様性への環境による分離の相対的重要性は,河川ネットワークにおいて便利にテストすることができ,そこでは,これらの2つのドライバーは,しばしば空間に独立して分布する。微生物個体群構造形成における分散と環境条件の重要性を評価するために,Eelとロシアの河川ネットワーク(California,USA)で採取した底生Microcoleus支配シアノバクテリアマットのゲノム分解メタゲノム解析を行った。64のMicrocoleusゲノムを,>96.5%の平均ヌクレオチド同一性(ANI)を共有する3つの種にクラスタ化した。大部分のマットは1つの菌株によって支配されたが,マット内のマイナーな対立遺伝子は,大きな空間距離(>300km)でさえ,しばしば共有された。最も一般的なMicrocoleus種内では,マット内の支配的な菌株間のANIは,空間分離の増加と共に減少した。しかし,より短い空間距離(キロメートル)では,異なるサブ流域からのマットは,同じサブ流域からのマットより低いANIを持ち,キャノピーカバー,伝導率,および平均年間温度のような因子におけるサブ流域間の環境差が,ANIを減少させることを示唆した。より小さなクリークにおけるマットは,より大きな下流サブ流域におけるマットとしてヌクレオチド多様性(π)の類似レベルを有したので,マット内遺伝的多様性は上流由来株の下流蓄積に依存するようには見えなかった。4配偶子試験および配列長バイアスは,大きな距離または異なる生息場所で生存した個体群間でも,各種内のほぼ全ての株間で組換が起こることを示唆する。全体として,我々の結果は,距離と環境条件によるいくつかの分離にもかかわらず,十分な遺伝子流がシアノバクテリア株間で生じ,流域を横断して特徴的な個体群構造を生産することにより,何れのドライバーも防ぐことを示した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  河川 ,  *流域 ,  ヌクレオチド ,  *藍藻類 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  対立遺伝子 ,  ミクロフローラ ,  配偶子 ,  *個体群 ,  生息場所
準シソーラス用語： *Microcoleus ,  環境条件 ,  *個体群構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 底生シアノバクテリア ,  生物地理学 ,  分散 ,  メタ個体群 ,  集団ゲノミクス ,  河川

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  個体群生態学  (EE03030S)

タイトルに関連する用語 (6件)： Microcoleus ,  藍藻類 ,  個体群構造 ,  勾配 ,  流域 ,  集団