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J-GLOBAL ID：202202218485311040   整理番号：22A0897582

小規模沿岸コミュニティにおけるSARS-CoV-2のための廃水監視:低有病率集団間のウイルス存在と変異体同定に及ぼす観光の影響【JST・京大機械翻訳】

Wastewater surveillance for SARS-CoV-2 in a small coastal community: Effects of tourism on viral presence and variant identification among low prevalence populations

著者 (21件)： Rainey Andrew L. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Rainey Andrew L. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Loeb Julia C. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Loeb Julia C. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Robinson Sarah E. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Robinson Sarah E. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Robinson Sarah E. (Center for Environmental and Human Toxicology, University of Florida, Gainesville, FL, 32611, USA) ,  Lednicky John A. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Lednicky John A. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  McPherson John (Cedar Key Water and Sewer District, Cedar Key, FL, 32625, USA) ,  Colson Sue (Cedar Key Chamber of Commerce, Cedar Key, FL, 32625, USA) ,  Allen Michael (Nature Coast Biological Station, Institute of Food and Agricultural Sciences, University of Florida, Cedar Key, FL, 32625, USA) ,  Coker Eric S. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Sabo-Attwood Tara (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Sabo-Attwood Tara (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Sabo-Attwood Tara (Center for Environmental and Human Toxicology, University of Florida, Gainesville, FL, 32611, USA) ,  Maurelli Anthony T. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Maurelli Anthony T. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Bisesi Joseph H. (Department of Environmental and Global Health, College of Public Health and Health Professions, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Bisesi Joseph H. (Emerging Pathogens Institute, University of Florida, Gainesville, FL, 32610, USA) ,  Bisesi Joseph H. (Center for Environmental and Human Toxicology, University of Florida, Gainesville, FL, 32611, USA)
資料名： Environmental Research  (Environmental Research)
巻： 208  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0574A  ISSN： 0013-9351  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 廃水ベース疫学はコミュニティ健康の指標として世界中の都市におけるSARS-CoV-2罹患率を測定するために使用されてきたが,大流行の始まりから小コミュニティの廃水におけるSARS-CoV-2の追跡は少なく,ウイルス負荷に対する観光の影響を評価した。したがって,本研究の目的は,2020年5月1日初めの12か月期間にわたって小島コミュニティにおけるウイルス傾向と変異をモニターするために,廃水におけるSARS-CoV-2の測定を使用することであり,コミュニティが観光客に再開放された。廃水試料を毎週採取し,SARS-CoV-2ゲノムコピーを検出し,定量化した。サンガー配列決定を用いて,SARS-CoV-2陽性廃水サンプルから抽出した全RNAからゲノム配列を決定した。監視データは,コマーセの地方Chaberから集められた。著者らは,コマーセのCedar Key Chamberへの訪問者がSARS-CoV-2陽性廃水サンプルおよびSARS-CoV-2 RNAの濃度に正に関連しているかどうかを決定するために,ポアソンおよび線形回帰を実施した。結果は,陽性試料が5連続週の4つで記録されたとき,毎週の廃水試料が7月中旬までSARS-CoV-2に対して陰性であることを示した。追加陽性結果は,2020年11月と12月に,また1月,3月と4月2021日に記録された。観光データは,廃水におけるSARS-CoV-2 RNA濃度が,毎週100人の旅行者あたり1.06Log_10ゲノムコピー/Lによって増加することを明らかにした。6つの陽性廃水試料からの配列決定は,SARS-CoV-2,2つの重複配列,および2つの低収率配列の二つの完全な配列をもたらした。それらは,2021年1月に新しい変異体SARS-CoV-2の到着を示した。著者らの結果は,小コミュニティにおけるSARS-CoV-2に対する廃水監視の有用性を実証した。廃水監視とウイルスゲノム配列決定は,個体群移動性が,高い観光を経験し,小さな個体群サイズを持つコミュニティ間のSARS-CoV-2変異体の導入と循環において,おそらく重要な役割を果たすことを示唆する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *廃水 ,  *観光 ,  コミュニティ ,  都市 ,  RNA【核酸】 ,  個体群 ,  疫学 ,  *沿岸 ,  人間 ,  性質
準シソーラス用語： *重症急性呼吸器症候群 ,  ウイルスゲノム ,  観光客 ,  旅行者 ,  ゲノム配列 ,  移動性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 廃水ベース疫学 ,  SARS-CoV-2 ,  COVID-19 ,  全ゲノム配列 ,  変異体 ,  観光

分類 (3件)： その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  環境汚染一般  (SB01000C) ,  粒状物調査測定  (SB03060E)

タイトルに関連する用語 (10件)： 沿岸 ,  コミュニティ ,  SARS-CoV-2 ,  廃水 ,  有病率 ,  集団 ,  ウイルス ,  変異体 ,  同定 ,  観光