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J-GLOBAL ID:202202219385587530   整理番号:22A1172452

非標的メタボロミクスと機械学習アルゴリズムに基づく早期死後潜水間隔(PMSI)推定と死因識別に関する予備研究【JST・京大機械翻訳】

A preliminary study on early postmortem submersion interval (PMSI) estimation and cause-of-death discrimination based on nontargeted metabolomics and machine learning algorithms
著者 (24件):
資料名:
巻: 136  号:ページ: 941-954  発行年: 2022年 
JST資料番号: T0122A  ISSN: 0937-9827  CODEN: IJLMEA  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: ドイツ (DEU)  言語: 英語 (EN)
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水中における死体の死後潜水間隔(PMSI)推定と死亡原因識別は,法医学診療において長い間課題であった。最近,多くの研究がPMI拡張による死後代謝変化にリンクし,メタボロームを用いてPMSIを推定するための潜在的戦略を提供した。さらに, d死同定のための高感度と特異性を有する潜在的指標の欠如がある。本研究では,液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析(LC-MS/MS)によって24時間以内の異なるPMSIsで, d死と死後の潜水ラットからの血液試料の非標的メタボロームをプロファイリングした。合計601の代謝産物を検出した。ランダムフォレスト(RF),部分最小二乗(PLS),サポートベクトルマシン(SVM),およびニューラルネットワーク(NN)を含む4つの異なる機械学習アルゴリズムを用いて,機械学習法の効率を比較した。明白な時間的規則性を有する19の代謝産物を,「IncNodePurity」に従って候補バイオマーカーとして選択した。ロバストモデルをこれらのバイオマーカーで構築し,平均絶対誤差1.067時間を得た。さらに,36の他の代謝物が, d死と死後の潜水(AUC=1,精度=95%)を識別するための分類器モデルを構築するために同定された。著者らの結果は,PMSI推定と死因識別における機械学習と組み合わせたメタボロミクスの潜在的応用を示した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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有機化合物の各種分析 

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