文献

J-GLOBAL ID：202202219456996472   整理番号：22A1024633

サトウキビ(Saccharum spp.種間雑種)の野生の前駆細胞と近縁種の間の根圏およびジアゾ栄養細菌多様性のハイスループットシークエンシングに基づく分析【JST・京大機械翻訳】

High-Throughput Sequencing-Based Analysis of Rhizosphere and Diazotrophic Bacterial Diversity Among Wild Progenitor and Closely Related Species of Sugarcane (Saccharum spp. Inter-Specific Hybrids)

著者 (19件)： Malviya Mukesh Kumar (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Li Chang-Ning (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Lakshmanan Prakash (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Lakshmanan Prakash (Interdisciplinary Research Center for Agriculture Green Development in Yangtze River Basin, College of Resources and Environment, Southwest University, Chongqing, China) ,  Lakshmanan Prakash (Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation, University of Queensland, St. Lucia, QLD, Australia) ,  Solanki Manoj Kumar (Plant Cytogenetics and Molecular Biology Group, Faculty of Natural Sciences, Institute of Biology, Biotechnology and Environmental Protection, University of Silesia in Katowice, Katowice, Poland) ,  Wang Zhen (Guangxi Key Laboratory of Agricultural Resources Chemistry and Biotechnology, College of Biology and Pharmacy, Yulin Normal University, Yulin, China) ,  Solanki Anjali Chandrol (Department of Agriculture Science, Mansarovar Global University, Bhopal, India) ,  Nong Qian (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Verma Krishan K. (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Singh Rajesh Kumar (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Singh Pratiksha (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Sharma Anjney (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Guo Dao-Jun (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Guo Dao-Jun (College of Agriculture, Guangxi University, Nanning, China) ,  Dessoky Eldessoky S. (Department of Biology, College of Science, Taif University, Taif, Saudi Arabia) ,  Song Xiu-Peng (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Li Yang-Rui (Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement (Guangxi), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Guangxi Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Sugarcane Research Institute, Guangxi Acade...) ,  Li Yang-Rui (College of Agriculture, Guangxi University, Nanning, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 829337  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物-微生物相互作用における遺伝的背景の有意な役割を考慮し,ほとんどの作物根圏微生物研究は栽培品種に焦点を当て,野生前駆細胞における根関連ミクロビオームの多様性を理解し,密接に関連する交雑種は,より良い品種を育種するのを助ける可能性がある。本研究は,サトウキビ,必須糖および2番目に大きなバイオエネルギー作物の野生祖先における根圏およびジアゾ栄養細菌多様性に関する重要な知識ギャップを埋めることを目指した。ハイスループットシークエンシング(HTS)プラットフォームを用いて,Saccharum officinarum L.cv.Badila(BRS),Saccharum barberi(S.barberi)Jesw.cv Pansahi(PRS),Saccharum shotaneum(S.spontaneum),SRS,Saccharum sinense (S.sinense) Roxb.cv Uba(URS)の16S rRNAとnifH遺伝子の配列決定により,根圏とジアゾ栄養細菌群落を調べた。。”S.barberi (S.barberi) Jesw.cv.cv.(RRS),Saccharum spontaneum(S.spontaneum),SRS],Saccharum sinense(S.sinense) Roxb.cv Uba(URS)。HTSの結果は,合計6,202の細菌特異的操作分類単位(OTU)を同定し,107の細菌群として分布したことを明らかにした。その内,31の根圏細菌科は,5つの種すべてで広く普及している。nifH遺伝子に関して,S.barberiおよびS.spontaneumは,それぞれ,OTUの最も高いおよび最も低い数を記録した。これらの結果を両遺伝子の定量的PCR分析により検証した。全部で1,099のOTUsを,すべてのサトウキビ種に分布する9科のコアミクロビオームを有するジアゾトロピーに対して同定した。コアミクロビオームは20属にわたって広がった。根圏における微生物多様性の増加は,主に土壌の物理化学的特性によるものであった。根圏細菌とジアゾ栄養の属の大部分は正相関を示し,少数の属は土壌特性と負相関した。結果は,サイズ可能な根圏多様性が,祖先と近縁種の間に存在することを示した。それでも,現代のサトウキビの祖先の根圏微生物豊度は,スペクトルのより低い末端にあり,Saccharum種移入育種の展望が,さらに,商業的サトウキビの栄養利用と病気とストレス耐性を改善するかもしれないことを示した。また,Saccharum種で見られる根圏ミクロビオームに対する大きな変動は,作物栽培中の根圏細菌-宿主植物会合の進化を研究するための知識ベースと実験システムを提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  *細菌 ,  rRNA ,  遺伝子 ,  *サトウキビ ,  *根圏 ,  土壌細菌 ,  *根 ,  育種 ,  栽培品種 ,  *サトウキビ属 ,  *生物多様性 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： *配列解析 ,  *近縁種 ,  根圏細菌 ,  微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 根圏土壌 ,  サトウキビ ,  nifH ,  16S rRNA ,  ジアゾ栄養の多様性

分類 (1件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (93件)：

• Aasfar A., Bargaz A., Yaakoubi K., Hilali A., Bennis I., Zeroual Y., et al. (2021). Nitrogen fixing azotobacter species as potential soil biological enhancers for crop nutrition and yield stability. Front. Microbiol. 12, 628379. doi: 10.3389/fmicb.2021.628379
• Ahmad F., Ahmad I., Aqil F., Ahmed Wani A., Sousche Y. S. (2016). Plant growth promoting potential of free-living diazotrophs and other rhizobacteria isolated from Northern Indian soil. Biotechnol. J. 1, 1112-1123. doi: 10.1002/biot.200600132
• Amna Xia, Y., Farooq M. A., Javed M. T., Kamran M. A., Mukhtar T., Ali J., et al. (2020). Multi-stress tolerant PGPR Bacillus xiamenensis PM14 activating sugarcane (Saccharum officinarum L.) red rot disease resistance. Plant Physiol. Biochem. 151, 640-649. doi: 10.1016/j.plaphy.2020.04.016
• Antoun H., Prévost D. (2005). “Ecology of plant growth promoting rhizobacteria,” in PGPR: Biocontrol and Biofertilization, ed Z. A. Siddiqui (Netherlands: Springer), 1-38. doi: 10.1007/1-4020-4152-7_1
• Armanhi J. S., de Souza R. S., Damasceno N. D., de Araújo L. M., Imperial J., Arruda P. A. (2018). Community-based culture collection for targeting novel plant growth-promoting bacteria from the sugarcane microbiome. Front. Plant Sci. 8, 2191. doi: 10.3389/fpls.2017.02191

タイトルに関連する用語 (10件)： サトウキビ ,  Saccharum ,  SPP ,  種間雑種 ,  前駆細胞 ,  近縁種 ,  根圏 ,  栄養 ,  細菌多様性 ,  分析