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J-GLOBAL ID：202202219548913976   整理番号：22A0491550

ETV4転写因子癌遺伝子のバイオインフォマティクススクリーニングと小分子抗癌剤の同定【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics screening of ETV4 transcription factor oncogenes and identifying small-molecular anticancer drugs

著者 (2件)： I.V Ambily Nath (Department of Computational Biology and Bioinformatics, University of Kerala, Thiruvananthapuram, Kerala, India) ,  Nair Achuthsankar S. (Department of Computational Biology and Bioinformatics, University of Kerala, Thiruvananthapuram, Kerala, India)
資料名： Chemical Biology & Drug Design  (Chemical Biology & Drug Design)
巻： 99  号： 2  ページ： 277-285  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1436A  ISSN： 1747-0277  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： このバイオインフォマティクス研究は,ETV4転写因子癌遺伝子を同定し,これらの遺伝子に対する抗癌剤を概説することを目的とした。最初に,GeneMANIAにおけるマルチオミクス資源に対するスクリーニングのための2つのクラスの質問としてフレーム化された既知の61のETV4癌標的を収集した。この方法は,各セットに機能的に類似した20遺伝子をアクセスし,添加した。これらのデータをハブ遺伝子,ネットワーククラスタリング,遺伝子オントロジー,および経路解析により解釈し,その結果,すべての得られた遺伝子が癌プロモーターであることを確認した。これらの遺伝子のプロモーター領域からETS結合モチーフを同定した。このように,23のETV4標的を図化して,腫瘍形成に関与するそれらを次の16の推定ノードとして濾過した:MMP8,MMP14,KDR,BRIP1,CXCR1,GRB14,SHC2,SHC4,SH2B1,SH2B2,INPPL1,PTPN3,GNG12,SEMA4D,RHOA,およびSPSB2。これら癌遺伝子の転写調節は,多くの癌経路を脱調節することを見出した広範なmiRNAネットワークにより協調した。DgIbデータベースを用いて,高品質6癌遺伝子-薬物組合せ(MMP8-CHEMBL1231240,MMP8-アミノメチルアミド,CXCR1-Reparixin,SEMA4D-Pepinemab,RHOA-Clausine E,およびSPSB2-CHEMBL175296)を提案した。これらの知見は,ETV4の新規腫瘍遺伝子ネクサスとその調節のための設計治療戦略の理解を前進させるかもしれない。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  *抗腫瘍薬 ,  プロモーター領域 ,  *小分子 ,  *スクリーニング ,  ギャップ結合 ,  *癌遺伝子 ,  治療計画 ,  *転写因子 ,  腫瘤形成
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *バイオインフォマティクス ,  転写調節 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 抗癌剤 ,  生物情報学 ,  ETV4 ,  既知の癌遺伝子 ,  新規癌遺伝子

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 転写因子 ,  癌遺伝子 ,  小分子 ,  抗癌剤 ,  同定