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J-GLOBAL ID：202202219555794396   整理番号：22A1025054

ネットワーク保存分析はアルツハイマー病と側頭葉てんかんとの間に共有される調節不全シナプスモジュールと調節ハブを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Network Preservation Analysis Reveals Dysregulated Synaptic Modules and Regulatory Hubs Shared Between Alzheimer’s Disease and Temporal Lobe Epilepsy

著者 (9件)： Harutyunyan Anna (1Department of Medicine, Royal Melbourne Hospital, University of Melbourne, Parkville, VIC, Australia) ,  Jones Nigel C. (1Department of Medicine, Royal Melbourne Hospital, University of Melbourne, Parkville, VIC, Australia) ,  Jones Nigel C. (2Department of Neuroscience, Central Clinical School, Monash University, Melbourne, VIC, Australia) ,  Jones Nigel C. (3Department of Neurology, The Alfred Hospital, Melbourne, VIC, Australia) ,  Kwan Patrick (1Department of Medicine, Royal Melbourne Hospital, University of Melbourne, Parkville, VIC, Australia) ,  Kwan Patrick (2Department of Neuroscience, Central Clinical School, Monash University, Melbourne, VIC, Australia) ,  Kwan Patrick (3Department of Neurology, The Alfred Hospital, Melbourne, VIC, Australia) ,  Anderson Alison (1Department of Medicine, Royal Melbourne Hospital, University of Melbourne, Parkville, VIC, Australia) ,  Anderson Alison (2Department of Neuroscience, Central Clinical School, Monash University, Melbourne, VIC, Australia)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 821343  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:アルツハイマー病(AD)患者におけるてんかんの有病率が増加している。共有病理および臨床的特徴が同定されているが,根底にある病態生理および原因効果関係は,あまり理解されていない。著者らは,これらの2つの疾患の間の遺伝子の一般的調節不全群を同定することを目的とした。方法:側頭葉てんかん(TLE)患者の海馬組織からの公的に利用可能なトランスクリプトームデータを用い,後期発症ADと非AD対照を用い,全ての3状態を示す遺伝子共発現ネットワークを構築した。次に,ネットワーク保存統計を用いて,TLE,ADと対照の間の機能的遺伝子モジュールの密度と連結性に基づく保存を比較し,モジュール保存の代理量子化器として有意性スコアの差を使用した。結果:機能的遺伝子モジュールの大部分(>90%)は,すべての共発現ネットワーク間で高度に保存されていたが,TLEネットワークで同定されたいくつかのモジュールは,対照のそれと比較してADネットワークで様々な程度の保存を示した。注目すべきことに,2つのシナプスシグナル伝達関連モジュールと2つの代謝モジュールは,保存の実質的な増加を示し,一方,ミエリン化と免疫システム関連モジュールは,保存の有意な損失を示した。遺伝子SCN3BとEPHA4は高度に保存されたシナプスシグナル伝達関連モジュールの中心調節ハブとして同定された。GABRB3とSCN2Aは,複数のてんかん活性と発作関連ヒト表現型オントロジーが豊富である,より小さな神経発生関連モジュールの中心調節ハブとして同定された。結論:これらのハブとその下流シグナル伝達経路は,ADとTLEの設定におけるシナプス活性の共通調節因子であり,ADにおけるてんかん発生において重要な役割を果たす可能性があると結論した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  遺伝子 ,  *シナプス ,  *てんかん ,  ヒト ,  ミエリン ,  海馬 ,  罹患率 ,  病態生理 ,  遺伝子発現 ,  発作 ,  *Alzheimer病 ,  病理 ,  細胞情報伝達 ,  オントロジー
準シソーラス用語： 共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： アルツハイマー病 ,  EphA4 ,  遺伝子ネットワーク ,  ネットワーク保存解析 ,  SCN3B ,  側頭葉てんかん ,  シナプスシグナリング ,  WGCNA

分類 (2件)： 神経系の疾患  (GN03000O) ,  神経の基礎医学  (GN01020W)

引用文献 (83件)：

• AdachiK., ToyotaM., SasakiY., YamashitaT., IshidaS., Ohe-ToyotaM., et al (2004). Identification of SCN3B as a Novel P53-Inducible Proapoptotic Gene. Oncogene 23 (47), 7791-7798. doi: 10.1038/sj.onc.1208067
• AkiyamaH., BargerS., BarnumS., BradtB., BauerJ., ColeG. M., et al (2000). Inflammation and Alzheimer's Disease. Neurobiol. Aging 21 (3), 383-421. doi: 10.1016/s0197-4580(00)00124-x
• AmatniekJ. C., HauserW. A., DelCastillo-CastanedaC., JacobsD. M., MarderK., BellK., et al (2006). Incidence and Predictors of Seizures in Patients with Alzheimer's Disease. Epilepsia 47 (5), 867-872. doi: 10.1111/j.1528-1167.2006.00554.x
• BarabásiA.-L., GulbahceN., LoscalzoJ. (2011). Network Medicine: A Network-Based Approach to Human Disease. Nat. Rev. Genet. 12 (1), 56-68. doi: 10.1038/nrg2918
• BerchtoldN. C., ColemanP. D., CribbsD. H., RogersJ., GillenD. L., CotmanC. W. (2013). Synaptic Genes Are Extensively Downregulated across Multiple Brain Regions in normal Human Aging and Alzheimer's Disease. Neurobiol. Aging 34 (6), 1653-1661. doi: 10.1016/j.neurobiolaging.2012.11.024

タイトルに関連する用語 (9件)： 保存 ,  分析 ,  アルツハイマー病 ,  側頭葉てんかん ,  共有 ,  調節 ,  シナプス ,  モジュール ,  ハブ