統合バイオインフォマティクスを用いた副腎皮質癌予後不良に関連する新規脂質代謝バイオマーカーの同定【JST・京大機械翻訳】

Subramanian Chitra; Cohen Mark S.; Cohen Mark S.

文献

J-GLOBAL ID：202202219622361805 整理番号：22A0229922

統合バイオインフォマティクスを用いた副腎皮質癌予後不良に関連する新規脂質代謝バイオマーカーの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of novel lipid metabolic biomarkers associated with poor adrenocortical carcinoma prognosis using integrated bioinformatics

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=22A0229922&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=22A0229922&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=C0796B") }}

著者 (3件)： , ,
資料名：
巻： 171 号： 1 ページ： 119-129 発行年： 2022年
JST資料番号： C0796B ISSN： 0039-6060 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

副腎皮質癌は稀であるが,しばしば,<15%の5年生存率を有する進行転移性疾患を示す。コレステロールに対する高い親和性を有する副腎皮質癌腫瘍にもかかわらず,副腎皮質癌における脂質の役割はよく記述されていない。したがって,著者らは,副腎皮質癌腫瘍進行または治療抵抗性を同定するのを助けるかもしれない不良生存と相関する新規脂質バイオマーカーを同定するために,統合バイオインフォマティクス分析を実施した。相関エンジンからのcolled副腎皮質癌研究のメタ分析は,副腎皮質癌と正常副腎の間で差次的に発現する脂質代謝遺伝子を同定し,次に,注釈,可視化および統合Discoveryデータベースのためのデータベースによる濃縮分析のために選択した。遺伝子の蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを,相互作用遺伝子/蛋白質および細胞景観の検索のための検索ツールを用いて構築した。同定されたトップハブ遺伝子は,Xenaデータベースを用いて検証された。ハブ遺伝子の生存分析を,癌ゲノムアトラスプログラムデータセットを用いて,R2ゲノム解析プラットフォームで行った。相関エンジンによる経路の検討は,副腎皮質癌腫瘍対正常組織(P<0.01)で特異的に調節される脂質代謝関連遺伝子のユニークなサブセットを同定した。注釈,可視化および統合Discoveryのデータベースにおける濃縮経路分析は,スフィンゴ脂質,ステロイドおよびペルオキシソーム増殖因子活性化受容体-α代謝に関与する遺伝子が副腎皮質癌でアップレギュレートされるが,グリセロールリン脂質,脂肪酸およびホスファチジルイノシトール代謝はダウンレギュレートされていることを示した。差次的に調節された遺伝子の生存分析は,SGPL1,FDFT1,SQLEのアップレギュレーションとPIK3C2B,PIK3CD,SYNJ2,DGAT1,PLA2G16,PLD1,GPD1のダウンレギュレーションが,副腎皮質癌患者における不良な全生存率(P<0.05)と有意に関連することを示した。スフィンゴ脂質とステロイド合成遺伝子のアップレギュレーションとホスファチジルイノシトールとグリセロールリン脂質代謝のダウンレギュレーションは,副腎皮質癌患者におけるより悪い生存と関連する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , , ,
, 【Automatic Indexing@JST】

内分泌系の腫よう

, , , , , ,

前のページに戻る