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J-GLOBAL ID:202202219766694701   整理番号:22A0889085

リンクオペレータ機能の選好は,臨界動力学に向けてBoole生物学的ネットワークを駆動することができる【JST・京大機械翻訳】

A preference for link operator functions can drive Boolean biological networks towards critical dynamics
著者 (6件):
資料名:
巻: 47  号:ページ: 17  発行年: 2022年 
JST資料番号: T0652A  ISSN: 0250-5991  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: ドイツ (DEU)  言語: 英語 (EN)
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Booleモデリングは,生物学的ネットワークの作動原理を理解するための強力なフレームワークである。これらのネットワークにおける生物学的実体間の調節論理はBoole関数(BF)として表現される。様々なタイプのBF(従って,規制論理規則)が存在し,それは生物学的状況において意味がある。本論文では,リンク演算子関数(LOF)として知られるそのようなタイプを調べた。これらの関数を理論的に列挙し,すべてのBFsの中で,また,生物学的に一貫した有効関数(EUFs)の中でさえ,LOFは小さな部分集合を形成することを示した。次に,AND-NOT LOFが再構成された生物学的Booleネットワークにおいて特に豊富であることを見出した。これらの事実,すなわち,EUFsの空間におけるLOFの小さい表現,および生物学的データセットにおけるそれらの存在によって,許容可能なモデルの空間が,BFsに対する定常状態制約の適用によって縮小でき,次に,それらの制約を満たすLOFの選択が続くことを示した。最後に,広い範囲のBFの中で,LOFは臨界に向けて生物学的ネットワーク動力学を駆動することを示した。Copyright Indian Academy of Sciences 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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分子・遺伝情報処理  ,  計算理論  ,  遺伝子発現 

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