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J-GLOBAL ID：202202220616684305   整理番号：22A0845167

Pseudomonas aeruginosa排出ポンプに対するコネシンの原子論的洞察とモデル解明【JST・京大機械翻訳】

Atomistic insight and modeled elucidation of conessine towards Pseudomonas aeruginosa efflux pump

著者 (7件)： Jewboonchu Juntamanee (EZ-Mol-Design Laboratory and Department of Biomedical Sciences, Faculty of Medicine, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand) ,  Saetang Jirakrit (EZ-Mol-Design Laboratory and Department of Surgery, Faculty of Medicine, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand) ,  Saeloh Dennapa (Faculty of Medical Technology, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand) ,  Siriyong Thanyaluck (Faculty of Thai Traditional Medicine, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand) ,  Rungrotmongkol Thanyada (Biocatalyst and Environmental Biotechnology Research Unit, Department of Biochemistry, Faculty of Science, and Program in Bioinformatics and Computational Biology, Graduate School, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand) ,  Voravuthikunchai Supayang Piyawan (Natural Product Research Center of Excellence, and Department of Microbiology, Faculty of Science, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand) ,  Tipmanee Varomyalin (EZ-Mol-Design Laboratory and Department of Biomedical Sciences, Faculty of Medicine, Prince of Songkla University, Songkhla, Thailand)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 4  ページ： 1480-1489  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬剤耐性緑膿菌排出ポンプは生存のために細胞から抗生物質を排出する。したがって,排出ポンプ阻害剤(EPI)は,薬剤耐性細菌を治療するための興味深い代替になる。Holarrhena antidysenterica由来の天然ステロイドアルカロイドであるコネシンは,以前に排出ポンプ阻害能を示した。著者らの分子ドッキングおよび分子動力学(MD)研究は,以前の実験報告をさらにするために,リン脂質二分子層膜における細菌MexB流出ポンプとコネシンの相互作用と同様に原子論的情報を提供した。ここでは,コネシンの結合部位と提案された作用機序を,PAβNまたは設計合成P9Dのような既知/市販EPIと比較して同定した。著者らの結果は,MexB排出ポンプに対する効果的な薬剤としての作用のコネシン結合様式を説明した。MDシミュレーションは,コネシンがグリシンループ(G-ループ)柔軟性に影響し,コネシンによるG-ループ柔軟性の低下が抗生物質押出を妨げることを示唆した。加えて,著者らの研究は,他の既知のEPIsと類似の排出ポンプの疎水性領域に埋め込まれたコネシンコア構造を示唆した。本知見は,P.aeruginosaに対する新規EPIとしてのコネシン誘導体の設計と開発の鍵として対処できた。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ドッキング ,  細菌 ,  疎水性 ,  抗生物質 ,  薬物耐性 ,  結合部位 ,  *緑膿菌 ,  コア構造 ,  *Pseudomonas ,  作用機序 ,  分子動力学 ,  分子認識
準シソーラス用語： *排出ポンプ ,  分子動力学シミュレーション ,  分子ドッキング ,  リン脂質二重層 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 排出ポンプ阻害剤 ,  コネシン ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  Pseudomonas aeruginosa

分類 (2件)： 細胞膜の輸送  (EF04020R) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

タイトルに関連する用語 (5件)： Pseudomonas ,  排出ポンプ ,  コネシン ,  洞察 ,  モデル