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J-GLOBAL ID：202202221250457565   整理番号：22A0842434

加重遺伝子共発現ネットワーク解析による閉塞性睡眠時無呼吸症候群関連遺伝子と経路の同定【JST・京大機械翻訳】

Identifying Obstructive Sleep Apnea Syndrome-Associated Genes and Pathways through Weighted Gene Coexpression Network Analysis

著者 (5件)： Li Yan (Department of Respiratory, Minhang Hospital, Fudan University, 170 Xinsong Road, Minhang District, Shanghai, China201199,) ,  Li Li (Department of Pulmonary Medicine, Minhang Branch, Zhongshan Hospital, Fudan University, 180 Fenglin Rd, Shanghai, China200032,) ,  Zhao Hua (Department of Respiratory, Minhang Hospital, Fudan University, 170 Xinsong Road, Minhang District, Shanghai, China201199,) ,  Gao Xiwen (Department of Respiratory, Minhang Hospital, Fudan University, 170 Xinsong Road, Minhang District, Shanghai, China201199,) ,  Li Shanqun (Department of Pulmonary Medicine, Minhang Branch, Zhongshan Hospital, Fudan University, 180 Fenglin Rd, Shanghai, China200032,)
資料名： Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web)  (Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7693A  ISSN： 1748-670X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.閉塞性睡眠時無呼吸症候群(OSAS)は睡眠時無呼吸障害の最も一般的なタイプである。疾患は患者の呼吸器系に大きく影響する。現在,疾患の予後は不良であり,有効な治療が不足している。したがって,その病因と治療法を探究することが急務である。方法.遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースに基づくOSASに関連したGSE75097から一連の発現プロファイルデータをダウンロードし,GSE75097データセットのサンプルから代表的な差次的発現遺伝子(DEG)を選択した。WGCNAを用いてOSASに関連する遺伝子を見出し,共発現モジュールを得た。遺伝子オントロジー(GO)機能および遺伝子およびゲノム(KEGG)経路の京都エンシクロペディアを用いて,鍵モジュールから遺伝子を分析した。最後に,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを構築し,ハブ遺伝子を分析するために,Cytoscapeソフトウェアを使用した。結果.合計7565のDEGを得た。WGCNAを通して,著者らは,4つの共発現モジュールを得て,OSASに最も関連するモジュールは,緑黄色,マゼンタ,紫,および膨満であり,著者らは,8つのハブ遺伝子(DDX46,RNF115,COPA,FBXO4,PA2G4,NHP2L1,CDC20,およびPCNA)をスクリーニングした。GOとKEGG分析は,主要なモジュールが主にtRNA修飾,核酸塩基代謝過程,DNAライゲーション,細胞成分移動の調節,基底転写因子,Huntington病,およびビタミン消化と吸収に富んでいることを示した。結論.これらの経路とハブ遺伝子はOSASの分子機構の理解を促進し,OSAS処理の生物学的標的を見つけるための意味のある参照を提供する。Copyright 2022 Yan Li et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  DNA【核酸】 ,  tRNA ,  *遺伝子 ,  ビタミン ,  ソフトウェア ,  予後 ,  遺伝子発現 ,  転写因子 ,  病因
準シソーラス用語： 分子機構 ,  *共発現 ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 呼吸器の疾患  (GI03000Z)

引用文献 (32件)：

• G. Gulotta et al., "Risk factors for obstructive sleep apnea syndrome in children: state of the art," International Journal of Environmental Research and Public Health, vol. 16, no. 18, 2019.
• C. Maspero et al., "Obstructive sleep apnea syndrome: a literature review," Minerva Stomatologica, vol. 64, no. 2, pp. 97-109, 2015.
• D. A. Dobrosielski et al., "Diet and exercise in the management of obstructive sleep apnoea and cardiovascular disease risk," European Respiratory Review, vol. 26, no. 144, 2017.
• A. Lo Bue, A. Salvaggio, G. Insalaco, "Obstructive sleep apnea in developmental age. A narrative review," European Journal of Pediatrics, vol. 179, no. 3, pp. 357-365, 2020.
• V. Stavrou et al., "Brief review: ergospirometry in patients with obstructive sleep apnea syndrome," Journal of Clinical Medicine, vol. 7, no. 8, 2018.

タイトルに関連する用語 (7件)： 加重 ,  遺伝子 ,  共発現 ,  ネットワーク解析 ,  閉塞性睡眠時無呼吸症候群 ,  経路 ,  同定