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J-GLOBAL ID：202202221351790816   整理番号：22A0896896

タンザニア人集団における機能的ゲノミクスアプローチは,ヨーロッパ集団と比較したサイトカイン産生の異なる遺伝的調節因子を同定する【JST・京大機械翻訳】

A functional genomics approach in Tanzanian population identifies distinct genetic regulators of cytokine production compared to European population

著者 (23件)： Boahen Collins K. (Department of Internal Medicine and Radboud Institute of Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Boahen Collins K. (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Temba Godfrey S. (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Temba Godfrey S. (Department of Medical Biochemistry and Molecular Biology, Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi 251, Tanzania) ,  Kullaya Vesla I. (Department of Medical Biochemistry and Molecular Biology, Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi 251, Tanzania) ,  Kullaya Vesla I. (Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Center, Moshi 251, Tanzania) ,  Matzaraki Vasiliki (Department of Internal Medicine and Radboud Institute of Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Matzaraki Vasiliki (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Joosten Leo A.B. (Department of Internal Medicine and Radboud Institute of Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Joosten Leo A.B. (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Kibiki Gibson (Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Center, Moshi 251, Tanzania) ,  Kibiki Gibson (Department of Paediatrics, Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi 251, Tanzania) ,  Mmbaga Blandina T. (Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Center, Moshi 251, Tanzania) ,  van der Ven Andre (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  van der Ven Andre (Department of Medical Biochemistry and Molecular Biology, Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi 251, Tanzania) ,  de Mast Quirijn (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Netea Mihai G. (Department of Internal Medicine and Radboud Institute of Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Netea Mihai G. (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Netea Mihai G. (Department for Genomics and Immunoregulation, Life and Medical Sciences Institute, University of Bonn, Bonn 53115, Germany) ,  Kumar Vinod (Department of Internal Medicine and Radboud Institute of Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Kumar Vinod (Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525, the Netherlands) ,  Kumar Vinod (University of Groningen, University Medical Center Groningen, Department of Genetics, Groningen 9700, the Netherlands) ,  Kumar Vinod (Nitte (Deemed to be University), Nitte University Centre for Science Education and Research, Medical Sciences Complex, Deralakatte, Mangalore 575018, India)
資料名： American Journal of Human Genetics  (American Journal of Human Genetics)
巻： 109  号： 3  ページ： 471-485  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0360B  ISSN： 0002-9297  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトは,微生物チャレンジで顕著な個体間および集団間免疫応答変動を示す。サイトカインは炎症と免疫応答の調節に重要な役割を果たすが,サイトカイン応答の調節不全は種々の病態に関与する。宿主遺伝因子は,主にヨーロッパベースの研究でサイトカイン応答不均一性に有意に影響することが示されているが,これらの知見が非ヨーロッパ人に移転可能であるかどうかは不明である。ここでは,タンザニアの東アフリカ祖先の健康な成人におけるサイトカイン応答を調節する遺伝的変異を同定することを目的とした。サイトカインと遺伝的データの両方を利用し,ゲノムワイドサイトカイン量的形質遺伝子座(cQTLs)マッピングを行った。結果を,直接重複および機能的濃縮分析により,西ヨーロッパ祖先の健康な成人の別のコホートと比較した。また,両集団において一致効果方向を持つcQTLsを同定するためにメタ分析を行った。タンザニアでは,cQTLマッピングは染色体22で80の独立した示唆遺伝子座と1つのゲノムワイド遺伝子座(TBC1D22A)を同定した。SNP rs12169244はSalmonella enteritidis刺激後のIL-1b放出と関連していた。注目すべきことに,同定されたcQTLsはヨーロッパのコホートと比較して有意に変化し,重複の非常に限られた割合(1.6%から1.9%)があった。さらに,誘導サイトカイン応答を調節する祖先特異的経路を観察し,特にタンザニアにおけるインターフェロン経路の顕著な濃縮があった。さらに,ヨーロッパとは反対に,TLR10-TLR1-TLR6遺伝子座における遺伝的変異はサイトカイン応答に影響しなかった。著者らのデータは,サイトカイン応答不均一性に対する遺伝的変異体と経路の祖先特異的影響を明らかにし,従って,ゲノム学研究への多様な集団を含むイニシアティブの重要性を主張する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  インターフェロン ,  炎症 ,  宿主 ,  *タンパク質合成 ,  ヒト ,  変異 ,  免疫反応 ,  遺伝子座 ,  *遺伝的調節 ,  腸炎菌 ,  母集団 ,  *サイトカイン ,  量的形質遺伝子座
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  *サイトカイン産生 ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： サイトカイン ,  遺伝的変異 ,  アフリカ ,  免疫ゲノミクス ,  QTL

分類 (1件)： 集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (6件)： タンザニア ,  集団 ,  ヨーロッパ ,  サイトカイン産生 ,  調節因子 ,  同定