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J-GLOBAL ID：202202221513374781   整理番号：22A1038345

肝細胞癌の新規診断および予後マーカーとしてのHOXファミリーメンバーの包括的分析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Analysis of HOX Family Members as Novel Diagnostic and Prognostic Markers for Hepatocellular Carcinoma

著者 (7件)： Jin Zhipeng (Department of Hepatobiliary Surgery, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China) ,  Sun Dongxu (Department of Hepatobiliary Surgery, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China) ,  Song Mengying (Department of Operation Room, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Zhu Wenjing (Clinical Research Center, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China) ,  Liu Huayuan (Department of Hepatobiliary Surgery, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China) ,  Wang Jianping (Department of Hepatobiliary Surgery, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China) ,  Shi Guangjun (Department of Hepatobiliary Surgery, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.ホメオボックス(HOX)遺伝子ファミリーは,ヒト癌に関与することが見出されている。しかしながら,肝細胞癌(HCC)におけるその関与は,あまり報告されていない。ここでは,HCCにおけるHOXの役割を包括的に評価した。【方法】TCGA-LIHCとLIRI-JPのRNA配列決定プロファイルを,それぞれ,癌ゲノムアトラス(TCGA)と国際癌ゲノムコンソーシアム(ICGC)から得た。TCGA-LIHCメチル化のデータをUCSC Xenaからダウンロードした。TCGA試料の遺伝的変化データをcBioPortalとGSCAから得た。ROC曲線を用いて診断効率を評価した。予後的意義は,Kaplan-Meier法およびCox回帰分析により評価した。クラスターProfilerパッケージssGSEA,ESTIMATE,およびTIDEアルゴリズムを用いて,その後の機能分析を行い,HOXとHCC微小環境の間の関係を調べた。最後に,pRRopheticパッケージとNCI-60癌細胞株を,抗癌剤感受性を推定するために適用した。結果.HCC組織におけるHOXのmRNAレベルは非癌組織より高く,全生存率(OS)不良と相関した。HOXA6,C6,D9,D10,およびD13はOSの独立危険因子として役立つ可能性がある。さらなる機能分析は,これら5つのHOXがHCCの細胞増殖,細胞周期,免疫応答および微小環境組成を調節することを明らかにした。加えて,HOXの異常な発現とメチル化は,HCCの診断で大きな価値がある。結論:HOXsはHCCにおいて重要な役割を果たし,HCC診断および予後に対する潜在的マーカーとして役立つ可能性がある。Copyright 2022 Zhipeng Jin et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  回帰分析 ,  メチル化 ,  mRNA ,  遺伝 ,  ヒト ,  免疫反応 ,  細胞増殖 ,  クラスタ ,  生存率 ,  *予後 ,  *肝細胞癌 ,  ホメオボックス遺伝子 ,  危険因子
準シソーラス用語： 微小環境 ,  全生存率 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (58件)：

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• J. D. Yang, P. Hainaut, G. J. Gores, A. Amadou, A. Plymoth, L. R. Roberts, "A global view of hepatocellular carcinoma: trends, risk, prevention and management," Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, vol. 16, no. 10, pp. 589-604, 2019.
• S. Roayaie, K. Obeidat, C. Sposito, L. Mariani, S. Bhoori, A. Pellegrinelli, D. Labow, J. M. Llovet, M. Schwartz, V. Mazzaferro, "Resection of hepatocellular cancer ≤2 cm: results from two Western centers," Hepatology, vol. 57, no. 4, pp. 1426-1435, 2013.
• J. M. Llovet, R. Montal, D. Sia, R. S. Finn, "Molecular therapies and precision medicine for hepatocellular carcinoma," Nature Reviews Clinical Oncology, vol. 15, no. 10, pp. 599-616, 2018.
• M. Billeter, Y.-q. Qian, G. Otting, M. Mu ̈ller, W. J. Gehring, K. Wu ̈thrich, "Determination of the three-dimensional structure of theAntennapedia homeodomain fromDrosophila in solution by1H nuclear magnetic resonance spectroscopy," Journal of Molecular Biology, vol. 214, no. 1, pp. 183-197, 1990.

タイトルに関連する用語 (6件)： 肝細胞癌 ,  診断 ,  予後マーカー ,  ファミリー ,  メンバー ,  分析