文献

J-GLOBAL ID：202202221640117854   整理番号：22A0647910

力場の選択は超分子CTA繊維の安定性と自己集合過程に影響を及ぼすか【JST・京大機械翻訳】

How the Choice of Force-Field Affects the Stability and Self-Assembly Process of Supramolecular CTA Fibers

著者 (3件)： Piskorz Tomasz K. (Department of Chemical Engineering, Delft University of Technology, HZ, The Netherlands) ,  de Vries A. H. (Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute and Zernike Institute for Advanced Materials, University of Groningen, The Netherlands) ,  van Esch Jan H. (Department of Chemical Engineering, Delft University of Technology, HZ, The Netherlands)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 18  号： 1  ページ： 431-440  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 近年,計算法は自己集合プロセスに焦点を当てた研究の必須要素となっている。それらはユニークな洞察を提供するが,それらは課題に直面しており,2つは文献の中で最も頻繁に言及される:自己組織化の時間的および空間的スケールである。あまり重要でないが,それほど重要ではない問題は,力場の選択である。超分子構造の反復特性は,多くの類似した相互作用をもたらした。従って,これらの相互作用における小さな偏差でさえ,全体の構造において顕著なエネルギー差をもたらす。しかし,自己集合システムに対する異なる力場を比較する研究は不足している。本論文では,異なる力場,すなわち,GROMOS,CHARMM一般力場(CGenFF),CHARMM Drude,一般的Amber Force-Field(GAFF),Martini,および分極Martiniを用いて実行した三重水素結合繊維に対する分子動力学シミュレーションを比較した。”この文献は,異なる力場,すなわち,GROMOS,CHARMM一般力場(CGenFF),CHARMM Drude,一般的Amber力-Field(GAFF),Martini,および分極Martini。簡潔に,著者らはシミュレーションによる力場をテストした。(i)自発的自己集合(ノンは500ns以内に繊維を形成する),(ii)繊維の安定性(CHARMM Drude,GAFF,MartiniP),(iii)二量化(GROMOS,GAFFおよびMartiniPについて観察),および(iv)オリゴマ化(CHARMM DrudeおよびMartiniPについて観察)。この系は,オリゴマとより大きな自己組織化構造における相互作用に関する力場挙動の知識が,自己集合系のための効率的なシミュレーションプロトコルを設計するために重要であることを示した。Copyright 2022 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エネルギーギャップ ,  シミュレーション ,  水素結合 ,  相互作用 ,  分極 ,  計算機シミュレーション ,  二量化 ,  オリゴマ ,  プログラムパッケージ ,  オリゴマ化 ,  *力の場 ,  自己組織化 ,  *超分子 ,  *自己集合 ,  超分子構造
準シソーラス用語： CHARMM ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 力場 ,  超分子 ,  CTA ,  繊維 ,  安定性 ,  自己集合 ,  過程