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J-GLOBAL ID：202202221933361491   整理番号：22A1178284

R2R3-MYB転写因子ファミリーのゲノムワイド同定と発現解析は,リュウガン(Dimocarpus longan)の開花過程において潜在的役割を明らかにした【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the R2R3-MYB Transcription Factor Family Revealed Their Potential Roles in the Flowering Process in Longan (Dimocarpus longan)

著者 (12件)： Chen Qinchang (College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Chen Qinchang (Center of Engineering Technology Research for Microalgae Germplasm Improvement of Fujian, Southern Institute of Oceanography, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Zhang Xiaodan (Department of Plant Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, United States) ,  Fang Yaxue (Center for Genomics and Biotechnology, Fujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems Biology, Key Laboratory of Genetics, Breeding and Multiple Utilization of Crops, Ministry of Education, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, China) ,  Wang Baiyu (Center for Genomics and Biotechnology, Fujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems Biology, Key Laboratory of Genetics, Breeding and Multiple Utilization of Crops, Ministry of Education, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, China) ,  Xu Shaosi (College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Xu Shaosi (Center of Engineering Technology Research for Microalgae Germplasm Improvement of Fujian, Southern Institute of Oceanography, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Zhao Kai (College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Zhao Kai (Center of Engineering Technology Research for Microalgae Germplasm Improvement of Fujian, Southern Institute of Oceanography, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Zhang Jisen (Center for Genomics and Biotechnology, Fujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems Biology, Key Laboratory of Genetics, Breeding and Multiple Utilization of Crops, Ministry of Education, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, China) ,  Fang Jingping (College of Life Sciences, Fujian Normal University, Fuzhou, China) ,  Fang Jingping (Center of Engineering Technology Research for Microalgae Germplasm Improvement of Fujian, Southern Institute of Oceanography, Fujian Normal University, Fuzhou, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 820439  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Longan(Dimocarpus longan Lour.)は熱帯および亜熱帯地域における高い栄養および医学的価値を有する生産的果実作物である。MYB遺伝子ファミリーは開花調節に関与する最も広範な植物転写因子(TF)ファミリーの1つである。しかし,リュウガンとその調節ネットワークにおける開花過程に関与するMYB TFについてはほとんど知られていない。本研究では,合計119のDlR2R3-MYB遺伝子をリュウガンゲノムで同定し,系統発生的に28のサブグループに分類した。グループ分けは,各サブグループにおけるDlR2R3-MYB遺伝子の高度に保存された遺伝子構造とモチーフ組成によって支持された。共線解析は,分節複製がタンデム重複と比較してDlR2R3-MYB遺伝子ファミリーの拡張においてより重要な役割を果たすことを示し,全てのタンデム/分節重複遺伝子対が精製選択下で進化した。リュウガンと5つの代表的種の間の種間シンテニー分析は,遺伝子重複事象の発生が種間の機能的分化に寄与する理由の1つであることを意味した。種々の組織からのRNA-seqデータは,DlR2R3-MYB遺伝子が組織特異的発現パターンを示したことを示した。花発生の経路は,6つのDlR2R3-MYB遺伝子で豊富であった。Cis作用要素予測は,DlR2R3-MYB遺伝子の推定機能が植物発育,植物ホルモン,および環境ストレスに関連することを明らかにした。特に,Arabidopsisとlongan R2R3-MYBメンバーの間のオルソロガス対応物は,開花調節とストレス応答において保存された役割を果たす傾向があった。KClO_3によるオフシーズン花誘導(FI)のトランスクリプトームプロファイリングは,対照群と比べて,KClO_3処理に対する応答に関与する2つの上方制御および4つの下方制御されたDlR2R3-MYB遺伝子を示した。さらに,qRT-PCRは,特定の遺伝子が花/花蕾において高い発現を示すことを確認した。細胞内局在実験は,3つの予測開花関連MYB蛋白質が核に局在することを明らかにした。開花発達に関与するこれらの潜在的候補遺伝子に関する今後の機能研究は,開花調節機構の理解をさらに深めることができた。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 応答 ,  農作物 ,  遺伝子 ,  植物ホルモン ,  タンパク質 ,  分化 ,  植物成長 ,  系統発生 ,  熱帯 ,  *開花 ,  果実【器官】 ,  *転写因子 ,  Arabidopsis ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Dimocarpus longan ,  R2R3-MYB ,  花の発達 ,  KClO_3 ,  qRT-PCR

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (115件)：

• Abbas F., Ke Y., Zhou Y., Yu Y., Waseem M., Ashraf U., et al (2021). Genome-wide analysis reveals the potential role of MYB transcription factors in floral scent formation in Hedychium coronarium. Front. Plant Sci. 12:623742. doi: 10.3389/fpls.2021.623742
• Bailey T. L., Boden M., Buske F. A., Frith M., Grant C. E., Clementi L., et al (2009). MEME SUITE: tools for motif discovery and searching. Nucleic Acids Res. 37 W202-W208. doi: 10.1093/nar/gkp335
• Bao S., Hua C., Shen L., Yu H. (2020). New insights into gibberellin signaling in regulating flowering in Arabidopsis. J. Integr. Plant Biol. 62 118-131. doi: 10.1111/jipb.12892
• Baudry A., Heim M. A., Dubreucq B., Caboche M., Weisshaar B., Lepiniec L. (2004). TT2, TT8, and TTG1 synergistically specify the expression of BANYULS and proanthocyanidin biosynthesis in Arabidopsis thaliana. Plant J. 39 366-380. doi: 10.1111/j.1365-313X.2004.02138.x
• Borges R., Miguel E. C., Dias J. M. R., Da Cunha M., Bressan-Smith R. E., De Oliveira J. G., et al (2004). Ultrastructural, physiological and biochemical analyses of chlorate toxicity on rice seedlings. Plant Sci. 166 1057-1062. doi: 10.1016/j.plantsci.2003.12.023

タイトルに関連する用語 (9件)： 転写因子 ,  ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析 ,  リュウガン ,  開花 ,  過程 ,  役割