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J-GLOBAL ID：202202221940363289   整理番号：22A1025002

COVID-19インターナリゼーションプロテアーゼの汎癌in silico解析:膜貫通プロテアーゼセリン-2【JST・京大機械翻訳】

A Pan-Cancer In Silico Analysis of the COVID-19 Internalization Protease: Transmembrane Proteaseserine-2

著者 (6件)： Meng Yiming (1Department of Central Laboratory, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Sun Jing (2Department of Biobank, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Zhang Guirong (1Department of Central Laboratory, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Yu Tao (3Department of Medical Imaging, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Piao Haozhe (1Department of Central Laboratory, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Piao Haozhe (4Department of Neurosurgery, Liaoning Cancer Hospital and Institute, Cancer Hospital of China Medical University, Shenyang, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 805880  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新しいコロナウイルス(2019-nCoV)は,ヒトで重度の呼吸器感染症を生じる可能性のある新興病原体である。罹患したCOVID-19患者の多くが悪性腫瘍を有することは注目に値する。さらに,癌はCOVID-19の個人危険因子として同定された。膜貫通プロテアーゼセリン-2(TMPRSS2)はS蛋白質活性化を仲介する重要な宿主プロテアーゼであり,最初は宿主細胞へのウイルス侵入を促進する。さらに,それは様々な腫瘍で異常に発現する。しかし,ヒト癌におけるTMPRSS2異常の系統的解析は解明されていない。ここでは,30以上の腫瘍におけるTMPRSS2の遺伝的変化,RNA発現およびDNAメチル化を分析した。TMPRSS2は,前立腺腺癌(PRAD)のような腫瘍で過剰発現し,対照的に,TMPRSS2の発現は,頭頚部癌(HNSC)のような腫瘍で低下することが報告されている。加えて,TMPRSS2低DNAメチル化も,この研究においてこれらのTMPRSS2高発現腫瘍の大部分で見出された。臨床研究は,TMPRSS2の発現といくつかの腫瘍患者の予後の間に有意な相関があることを見出した。TMPRSS2の発現は癌関連線維芽細胞の浸潤にも関連しており,KEGG/GO濃縮により潜在的経路と機能的メカニズムを分析した。最後に,本研究は,ヒト悪性腫瘍におけるTMPRSS2の遺伝的および後成的変異を初めて計画し,TMPRSS2の発癌効果の比較的包括的な理解を提供した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： メチル化 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝 ,  宿主 ,  腫瘍 ,  発癌 ,  ヒト ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  病原体 ,  呼吸器感染症 ,  危険因子
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  悪性腫瘍 ,  宿主細胞 ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： COVID-19 ,  tmprss2 ,  発現 ,  メチル化 ,  相関

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (32件)：

• BaoR., HernandezK., HuangL., LukeJ. J. (2020). ACE2andTMPRSS2expression by Clinical, HLA, Immune, and Microbial Correlates across 34 Human Cancers and Matched normal Tissues: Implications for SARS-CoV-2 COVID-19. J. Immunother. Cancer 8 (2), e001020. doi: 10.1136/jitc-2020-001020
• BardouP., MarietteJ., EscudiéF., DjemielC., KloppC. (2014). Jvenn: an Interactive Venn Diagram Viewer. BMC Bioinformatics 15, 293. doi: 10.1186/1471-2105-15-293
• BarnesC. O., JetteC. A., AbernathyM. E., DamK.-M. A., EssweinS. R., GristickH. B., et al (2020). SARS-CoV-2 Neutralizing Antibody Structures Inform Therapeutic Strategies. Nature 588 (7839), 682-687. doi: 10.1038/s41586-020-2852-1
• BuchrieserJ., DuflooJ., HubertM., MonelB., PlanasD., RajahM. M., et al (2021). Syncytia Formation by SARS-CoV-2-infected Cells. EMBO J. 40 (3), e107405. doi: 10.15252/embj.2020107405
• ChandrashekarD. S., BashelB., BalasubramanyaS. A. H., CreightonC. J., Ponce-RodriguezI., ChakravarthiB. V. S. K., et al (2017). UALCAN: A Portal for Facilitating Tumor Subgroup Gene Expression and Survival Analyses. Neoplasia 19 (8), 649-658. doi: 10.1016/j.neo.2017.05.002

タイトルに関連する用語 (3件)： COVID-19 ,  癌 ,  解析