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J-GLOBAL ID：202202222064501779   整理番号：22A1030131

代謝工学における粗粒モデルの応用【JST・京大機械翻訳】

Applications of Coarse-Grained Models in Metabolic Engineering

著者 (4件)： Doan Dieu Thi (1Systems Biotechnology, TUM School of Engineering and Design, Technische Universitaet Muenchen, Garching, Germany) ,  Hoang Manh Dat (2Biochemical Engineering, TUM School of Engineering and Design, Technische Universitaet Muenchen, Garching, Germany) ,  Heins Anna-Lena (2Biochemical Engineering, TUM School of Engineering and Design, Technische Universitaet Muenchen, Garching, Germany) ,  Kremling Andreas (1Systems Biotechnology, TUM School of Engineering and Design, Technische Universitaet Muenchen, Garching, Germany)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 806213  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 数学的モデリングは細胞プロセスをより良く理解するための有望なツールである。近年,粗粒モデルの開発は,これらの単純なモデルが広範囲の成長条件を捉え,記述することができるので,魅力を獲得した。粗粒モデルはしばしば2つの細胞成分,中心代謝とエネルギー生成の代表として低分子量成分,および全プロテオームを表す高分子成分のみから成る。バイオテクノロジー生産プロセスにおける細菌増殖のための厳密な質量保存モデルを提示するフレームワークを提示した。定常状態溶液に対する興味深い性質を提供した後,応用は,1)アミノ酸の生産プロセスおよび2)中心代謝からの代謝産物の生産に対して示した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *生物学 ,  細胞 ,  *代謝 ,  代謝産物 ,  高分子 ,  *モデル ,  細胞構成体 ,  低分子量 ,  生産プロセス ,  バイオテクノロジー ,  プロテオーム
準シソーラス用語： *代謝工学 ,  *粗粒モデル ,  細菌増殖 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 数学モデリング ,  資源配分 ,  動力学モデル ,  代謝工学 ,  システムバイオテクノロジー ,  代謝および遺伝子調節ネットワーク ,  微生物増殖

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (20件)：

• BasanM., HuiS., OkanoH., ZhangZ., ShenY., WilliamsonJ. R., et al (2015). Overflow Metabolism in escherichia Coli Results from Efficient Proteome Allocation. Nature 528, 99-104. doi: 10.1038/nature15765
• BertauxF., von KügelgenJ., MargueratS., ShahrezaeiV. (2020). A Bacterial Size Law Revealed by a Coarse-Grained Model of Cell Physiology. Plos Comput. Biol. 16, e1008245. doi: 10.1371/journal.pcbi.1008245
• BollenbachT., QuanS., ChaitR., KishonyR. (2009). Nonoptimal Microbial Response to Antibiotics Underlies Suppressive Drug Interactions. Cell 139, 707-718. doi: 10.1016/j.cell.2009.10.025
• BosdrieszE., MolenaarD., TeusinkB., BruggemanF. J. (2015). How Fast-growing Bacteria Robustly Tune Their Ribosome Concentration to Approximate Growth-rate Maximization. Febs J. 282, 2029-2044. doi: 10.1111/febs.13258
• GiordanoN., MairetF., GouzéJ.-L., GeiselmannJ., de JongH. (2016). Dynamical Allocation of Cellular Resources as an Optimal Control Problem: Novel Insights into Microbial Growth Strategies. Plos Comput. Biol. 12, e1004802. doi: 10.1371/journal.pcbi.1004802

タイトルに関連する用語 (3件)： 代謝工学 ,  粗粒モデル ,  応用