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J-GLOBAL ID：202202222159433922   整理番号：22A1064286

グラフ注意ネットワークに基づくアミノ酸環境親和性モデル【JST・京大機械翻訳】

Amino acid environment affinity model based on graph attention network

著者 (7件)： Tong Xueheng (College of Computer Science and Technology, Jilin University, Qianjing Street 2699, Changchun, Jilin 130012, China) ,  Liu Shuqi (College of Computer Science and Technology, Jilin University, Qianjing Street 2699, Changchun, Jilin 130012, China) ,  Gu Jiawei (College of Computer Science and Technology, Jilin University, Qianjing Street 2699, Changchun, Jilin 130012, China) ,  Wu Chunguo (College of Computer Science and Technology, Jilin University, Qianjing Street 2699, Changchun, Jilin 130012, China) ,  Liang Yanchun (School of Computer Science, Zhuhai College of Science and Technology Zhuhai, Guangdong 519041, China) ,  Shi Xiaohu (College of Computer Science and Technology, Jilin University, Qianjing Street 2699, Changchun, Jilin 130012, China) ,  Shi Xiaohu (School of Computer Science, Zhuhai College of Science and Technology Zhuhai, Guangdong 519041, China)
資料名： Journal of Bioinformatics and Computational Biology  (Journal of Bioinformatics and Computational Biology)
巻： 20  号： 1  ページ： 2150032  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1491A  ISSN： 0219-7200  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： シンガポール (SGP)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質は,ほとんど全ての機能に関与するエンジンである。それらはアミノ酸から成る1つ以上のポリペプチド鎖のねじれと折畳みにより形成された特異的空間構造を有した。蛋白質部位は,構造または機能が存在する3次元位置および局所近傍により同定できる蛋白質構造微小環境である。アミノ酸環境親和性の理解は,変異分析と機能的部位検出のような付加的蛋白質構造または機能研究に必須である。本研究では,グラフ注意ネットワークに基づくアミノ酸環境親和性モデルを開発した。最初に,アミノ酸対間の距離に従って蛋白質グラフを構築した。次に,各ノードに対する一連の構造的特徴を抽出した。最後に,蛋白質グラフと関連ノード特徴集合をグラフ注意ネットワークモデルを入力し,アミノ酸親和性を得るために設定した。数値結果により,提案手法は,最近の3DCNNベース法よりも,約30%優れていることが分かった。Copyright 2022 World Scientific Publishing Company All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子構造 ,  *ネットワーク ,  ニューラルネットワーク ,  立体構造 ,  *アミノ酸 ,  ポリペプチド ,  タンパク質 ,  環境 ,  折畳み ,  *親和性 ,  ねじり変形 ,  三次元 ,  構造特性
準シソーラス用語： ネットワークモデル ,  微小環境 ,  変異解析 ,  蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 深層学習 ,  グラフニューラルネットワーク ,  グラフ注意ネットワーク ,  蛋白質構造

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： グラフ ,  注意 ,  アミノ酸 ,  環境親和性 ,  モデル