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J-GLOBAL ID：202202222407471910   整理番号：22A0792315

柔軟なリンカーはTP901-1CIファージレプレッサーのDNAへの結合親和性を調節する【JST・京大機械翻訳】

Flexible linker modulates the binding affinity of the TP901-1 CI phage repressor to DNA

著者 (6件)： Varming Anders Kokkenborg (Department of Chemistry, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Rasmussen Kim Krighaar (Department of Chemistry, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Zong Zhiyou (Department of Chemistry, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Thulstrup Peter Waaben (Department of Chemistry, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Kilstrup Mogens (Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark) ,  Lo Leggio Leila (Department of Chemistry, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark)
資料名： FEBS Journal  (FEBS Journal)
巻： 289  号： 4  ページ： 1135-1148  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0206B  ISSN： 1742-464X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一時的なバクテリオファージは,宿主細菌の感染後の2つのライフサイクル,すなわち溶菌性または溶原性ライフサイクルの間を切り替えることができる。これら間の選択は双安定遺伝子スイッチにより制御される。2つの調節蛋白質,Clear 1(CI)レプレッサーおよび抑制因子(MOR)抑制因子により制御される,ラクトコッカス温帯バクテリオファージ,TP901-1の遺伝的スイッチを検討した。CIはDNA結合N末端ドメインと柔軟なドメイン間リンカーにより連結されたオリゴマ化に関与するC末端ドメインから成る。全長CIは六量体であり,一方,第2のC末端サブドメインを欠く58のC末端残基(CIΔ58)を有する短縮型バージョンCIは二量体であるが,溶解遺伝子転写抑制に関与するO_Lオペレータ部位に対する完全長CIと同じ親和性と結合している。より短い,より長い,およびPP置換リンカーを有するCIΔ58の3つの変異体を作成し,円偏光二色分光法およびナノ示差走査熱量測定により,十分に折り畳まれることを確認した。小角X線散乱により,溶液中の変異体および野生型によりサンプリングされた立体配座空間を描写し,リンカーの短縮および延長が,分子動力学および意図したように,それぞれ減少および増加することを見出した。等電点電気泳動は,すべての変異体がMOR抗レプレッサーに結合できることを確認した。しかし,電気泳動移動度シフトアッセイを用いて,リンカーの短縮と延長がO_Lへの親和性のそれぞれ94倍と17倍の減少をもたらすことを示した。したがって,適切なリンカー長は,適切なDNA結合とその後のTP901-1遺伝子スイッチ機能に重要であると思われる。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  ライフサイクル ,  *DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  突然変異体 ,  バクテリオファージ ,  二量体 ,  *レプレッサー ,  *親和性 ,  オリゴマ化 ,  示差走査熱量測定 ,  野生型
準シソーラス用語： *リンカ ,  DNA結合 ,  ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： バクテリオファージ ,  柔軟なリンカー ,  遺伝子スイッチ ,  溶原性 ,  レプレッサー

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： リンカー ,  DNA ,  結合親和性 ,  調節