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J-GLOBAL ID：202202222472142466   整理番号：22A1051082

中国における水生生態系のDNAベースバイオモニタリングのギャップ解析【JST・京大機械翻訳】

Gap analysis for DNA-based biomonitoring of aquatic ecosystems in China

著者 (10件)： Li Feilong (Guangdong Provincial Key Laboratory of Water Quality Improvement and Ecological Restoration for Watersheds, School of Ecology, Environment and Resources, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006, China) ,  Li Feilong (Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Guangzhou), Guangzhou 511458, China) ,  Zhang Yuan (Guangdong Provincial Key Laboratory of Water Quality Improvement and Ecological Restoration for Watersheds, School of Ecology, Environment and Resources, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006, China) ,  Altermatt Florian (Department of Aquatic Ecology, Eawag: Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology, UEberlandstrasse 133, CH-8600 Duebendorf, Switzerland) ,  Altermatt Florian (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Winterthurerstrasse 190, 8057 Zuerich, Switzerland) ,  Zhang Xiaowei (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, Nanjing 210023, China) ,  Cai Yanpeng (Guangdong Provincial Key Laboratory of Water Quality Improvement and Ecological Restoration for Watersheds, School of Ecology, Environment and Resources, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006, China) ,  Cai Yanpeng (Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Guangzhou), Guangzhou 511458, China) ,  Yang Zhifeng (Guangdong Provincial Key Laboratory of Water Quality Improvement and Ecological Restoration for Watersheds, School of Ecology, Environment and Resources, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006, China) ,  Yang Zhifeng (Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Guangzhou), Guangzhou 511458, China)
資料名： Ecological Indicators  (Ecological Indicators)
巻： 137  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1221A  ISSN： 1470-160X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAベースの分類群同定は,河川における生物多様性の評価と管理を改善する。しかし,包括的DNAバーコード参照ライブラリーとグローバルに高度に不等な被覆の欠如は,世界中のこの方法の応用展望をまだ妨げている。ここでは,中国の河川における3つの水生動物群(淡水魚,水生昆虫および軟体動物)に焦点を絞って,2つの参照ライブラリー,生命データシステム(BOLD)およびNCBI GenBankにおけるCOIバーコードギャップを分析した。著者らのデータは,BOLDまたはNCBI GenBankデータベースにおいて,これらのグループにおける分類群の約40~70%のバーコード被覆(例えば,バーコードのない生物)におけるギャップを示した。これらのギャップは,バーコード閾値が1分類群当たり少なくとも5つの参照配列を含むように設定されるとしても,さらに上昇できる。さらに,ほとんどのバーコードは非局所サンプルからであり,参照配列の14.4%(BOLD)と28.8%(NCBI GenBank)は,それぞれ中国で採取した生物からであった。局所バーコードのペアワイズ遺伝距離は非局所バーコードより3から5倍低く,後者が良好な代替品ではないことを示した。個々の流域を見ると,潜在的に発生する水生種の約60%は1つ以上のバーコードを持つが,バーコード被覆率は54.3%(Liao川流域)から68.2%(Huai川流域)までの10の主要な河川流域でわずかに変化する。水生昆虫の淡水魚,OdonataとDipteraの分類群SalmonformesとPercformes,および軟体動物のBivalviaは,ほとんどの流域(平均被覆率>70%)で最良のバーコード被覆を有する。本研究は,中国の河川における3つの主要な水生動物群のバーコード参照ライブラリーの最初の概観と現状を示した。著者らの結果は,中国からの現在のメタバーコーディング研究をより良く解釈することを助け,また,中国の水生種の参照ライブラリーにおけるギャップを埋める戦略を開発する基礎を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  被覆 ,  河川 ,  流域 ,  *DNA【核酸】 ,  軟体動物 ,  淡水魚 ,  トンボ類 ,  双翅類 ,  バーコード ,  生物多様性 ,  河川流域
準シソーラス用語： 水生昆虫 ,  分類群 ,  *水圏生態系 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAバーコード化 ,  環境DNA ,  淡水魚 ,  水生昆虫 ,  軟体動物

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  動物性水産食品  (FJ13020C)

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  水生生態系 ,  DNA ,  バイオモニタリング ,  ギャップ ,  解析