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J-GLOBAL ID：202202222479091348   整理番号：22A1023678

適度なCOVID-19における液性免疫応答の動力学評価によるスパイク蛋白質エピトープの評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of Spike Protein Epitopes by Assessing the Dynamics of Humoral Immune Responses in Moderate COVID-19

著者 (22件)： Chen Lingyun (1College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Chen Lingyun (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Pang Pengfei (3Center for Interventional Medicine, The Fifth Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Zhuhai, China) ,  Qi Huan (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Yan Keqiang (1College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Yan Keqiang (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Ren Yan (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Ma Mingliang (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Cao Ruyin (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Li Hua (5State Key laboratory for Oncogenes and Bio-ID Center, School of Biomedical Engineering, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Hu Chuansheng (5State Key laboratory for Oncogenes and Bio-ID Center, School of Biomedical Engineering, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Li Yang (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Xia Jun (1College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Xia Jun (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Lai Danyun (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Dong Yuliang (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China) ,  Jiang Hewei (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Zhang Hainan (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Shan Hong (3Center for Interventional Medicine, The Fifth Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Zhuhai, China) ,  Tao Shengce (4Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Liu Siqi (1College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Liu Siqi (2Department of Proteomics, Beijing Genomics Institution, Shenzhen, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 770982  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コロナウイルス病2019(COVID-19)パンデミックは,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)と呼ばれる新規コロナウイルスによって引き起こされる。SARS-CoV-2のスパイク蛋白質(S)は,ウイルス感染および宿主免疫における必須の役割のため,診断およびワクチン開発の主要な標的である。現在,種々のS蛋白質エピトープに対する体液性免疫系の時間依存性応答はほとんど理解されていない。本研究では,酵素結合イムノソルベントアッセイ(ELISA),ペプチドマイクロアレイおよび抗体結合エピトープマッピング(AbMap)法を用いて,症状発症後約2か月間入院した中等度COVID-19患者の小コホートにおけるS蛋白質に対する体液性免疫反応の動的変化を系統的に解析した。組換え切断S蛋白質,標的Sペプチド,およびランダムペプチドを,分析において抗原として使用した。アッセイは,患者依存性パターンを有する種々のS蛋白質エピトープに対する動的IgMおよびIgG認識および反応性を示した。ホモトリマーS蛋白質のスパイク遺伝子配列と空間構造に沿ったエピトープ分布の包括的解析は,大部分のIgMとIgG反応性ペプチドが類似のゲノム領域にクラスタ化され,アクセス可能なドメインに位置することを示した。7つのSペプチドは,一般的にすべてのCOVID-19患者の血清サンプルに由来するIgG抗体によって認識された。これら7つのSペプチドからの動的免疫認識シグナルは,全S蛋白質または切断S1蛋白質のそれに匹敵した。これは,体液性免疫系が,症状発症後の体液性免疫反応の全期間において,ほとんどのCOVID-19患者において,保存されたS蛋白質エピトープをほとんど認識しないことを示唆した。さらに,このコホートにおいて,個々の患者は入院期間を通して特定のS蛋白質エピトープに対して安定な免疫認識を示した。したがって,S蛋白質に対する体液性免疫反応の動的特性は,COVID-19患者の正確な診断および免疫療法のための貴重な情報を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ペプチド ,  ウイルス感染 ,  血清 ,  *タンパク質 ,  *免疫 ,  免疫グロブリンG ,  免疫グロブリンM ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  *ウイルスタンパク質 ,  免疫療法 ,  症状 ,  ELISA ,  *エピトープ
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *スパイク蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： SARS-CoV-2 ,  COVID-19 ,  S蛋白質 ,  エピトープ ,  動力学 ,  ELISA ,  マイクロアレイ ,  AbMap

分類 (2件)： 免疫療法薬・血液製剤の基礎研究  (GW22010D) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

引用文献 (58件)：

• Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The Species Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus: Classifying 2019-nCoV and Naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol (2020) 5(4):536-44. doi: doi: 10.1038/s41564-020-0695-z
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• Rabaan AA, Al-Ahmed SH, Haque S, Sah R, Tiwari R, Malik YS, et al. SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-COV: A Comparative Overview. J Infez Med (2020) 28(2):174-84. doi: 10.1016/j.cll.2009.07.007
• Wu JT, Leung K, Bushman M, Kishore N, Niehus R, de Salazar PM, et al. Estimating Clinical Severity of COVID-19 From the Transmission Dynamics in Wuhan, China. Nat Med (2020) 26(4):506-10. doi: doi: 10.1038/s41591-020-0822-7

タイトルに関連する用語 (7件)： COVID-19 ,  液性免疫 ,  応答 ,  動力学 ,  評価 ,  スパイク蛋白質 ,  エピトープ