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J-GLOBAL ID：202202222919803057   整理番号：22A0102759

プロテオバクテリアにおける遺伝子内コドン使用:翻訳選択,IS拡大およびゲノム収縮【JST・京大機械翻訳】

Intragenic codon usage in proteobacteria: Translational selection, IS expansion and genomic shrinkage

著者 (1件)： Fuglsang Anders (Beckersvej 13, 7120 Vejle O, Denmark)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 809  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿では,対応分析とコドンの有効数を用いてコドン使用の遺伝子内変異を系統的に研究する方法を示した。この方法を>1100プロテオバクテリアに適用した。Codon使用バイアス(慣性として測定)はゲノムサイズと共に増加し,同じは最初の軸で説明される慣性の割合に対して真実である。遺伝子末端近くの緩和またはより均一なコドン使用がしばしば存在することを示した。それは,n小ゲノム,特にBuchnera aphidicolaまたはRickettsia prowazekiiのような細胞内生物のそれらに見られず,そこでは翻訳選択が役割のより少ない役割を果す。E.coli由来の遺伝子では,翻訳選択がよく記述されている,それぞれ,低,中間および高発現に分割され,末端でのより均一な使用による遺伝子内コドン使用パターンが3つの発現群すべてにわたって存在することを示した。さらに,対応分析は,IS拡張によるBordetella百日咳におけるユニークなパターンを明らかにした。したがって,本研究は,翻訳選択,ゲノム収縮およびIS拡張が遺伝子内コドン使用における特徴的パターンをもたらすことを示す。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *コドン ,  *ゲノム ,  Bordetella ,  百日咳 ,  バイアス ,  挿入配列
準シソーラス用語： 発疹チフスリケッチア ,  *プロテオバクテリア ,  コレスポンデンス分析 ,  ゲノムサイズ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Codon使用 ,  対応分析 ,  挿入配列 ,  選択 ,  ゲノム縮小

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： プロテオバクテリア ,  コドン ,  翻訳 ,  IS ,  拡大 ,  ゲノム ,  収縮