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J-GLOBAL ID：202202223061640561   整理番号：22A0696451

部分相関に基づく遺伝子ネットワーク再配線の同定【JST・京大機械翻訳】

Identifying Gene Network Rewiring Based on Partial Correlation

著者 (5件)： Tan Yu-Ting (School of Mathematics and Statistics and Hubei Key Laboratory of Mathematical Sciences, Central China Normal University, Wuhan, Hubei, China) ,  Ou-Yang Le (College of Information Engineering and Shenzhen Key Laboratory of Media Security, Shenzhen University, Shenzhen, Guangdong, China) ,  Jiang Xingpeng (School of Computer, Central China Normal University, Wuhan, Hubei, China) ,  Yan Hong (Department of Electrical Engineering, City University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Zhang Xiao-Fei (School of Mathematics and Statistics and Hubei Key Laboratory of Mathematical Sciences, Central China Normal University, Wuhan, Hubei, China)
資料名： IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics  (IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics)
巻： 19  号： 1  ページ： 513-521  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1409A  ISSN： 1545-5963  CODEN： ITCBCY  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 異なる条件下で遺伝子調節ネットワークがどのように変化するかを学ぶことは重要な仕事である。いくつかのGaussグラフィカルモデルベースの方法を,遺伝子発現データから微分ネットワークを推論することによって,このタスクを処理するために提案した。しかしながら,ほとんどの既存の方法は,精度行列の差として微分ネットワークを定義し,それは条件付き分散の変化によって引き起こされた偽微分エッジを含むかもしれない。さらに,条件特異的ネットワークと微分ネットワークに関する事前情報を他のドメインから得る。事前情報を微分ネットワーク解析に組み入れることは有用である。本研究では,上記の課題に対処する新しい微分ネットワーク解析法を提案した。精度行列を使用する代わりに,条件付き分散のバリアントによる偽微分エッジを除外できる部分相関の差として微分ネットワークを定義した。さらに,多重仮説テストからの事前情報を,加重融合ペナルティを用いて取り込んだ。シミュレーション研究は,著者らの方法が競合する方法より優れていることを示した。また,この方法を適用して,乳癌の内腔Aと基底様サブタイプと急性骨髄性白血病腫瘍と正常試料との間の異なるネットワークとの間の差動ネットワークを同定した。著者らの方法によって同定された差動ネットワークにおけるハブ遺伝子は,重要な生物学的機能を実行する。Copyright 2022 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 行列 ,  シミュレーション ,  データ ,  *ネットワーク ,  *配線 ,  *遺伝子 ,  仮説検定 ,  微分 ,  多重化 ,  ペナルティ ,  乳房腫瘍 ,  急性骨髄性白血病
準シソーラス用語： 事前知識 ,  ネットワーク解析 ,  *遺伝子ネットワーク ,  遺伝子発現データ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 信号理論  (ND02020G)

タイトルに関連する用語 (3件)： 部分相関 ,  遺伝子ネットワーク ,  同定