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J-GLOBAL ID：202202223318350094   整理番号：22A1178560

チオレドキシン(Trx)遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と発現解析はコムギ(Triticum aestivum L.)における赤さび病抵抗性におけるその役割を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the Thioredoxin (Trx) Gene Family Reveals Its Role in Leaf Rust Resistance in Wheat (Triticum aestivum L.)

著者 (10件)： Bhurta Ramesh (1Division of Genetics, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Hurali Deepak T. (1Division of Genetics, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Tyagi Sandhya (2Division of Plant Physiology, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Sathee Lekshmy (2Division of Plant Physiology, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Adavi B Sandeep (2Division of Plant Physiology, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Singh Dalveer (2Division of Plant Physiology, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Mallick Niharika (1Division of Genetics, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Chinnusamy Viswanathan (2Division of Plant Physiology, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Vinod (1Division of Genetics, ICAR-IARI, New Delhi, India) ,  Jha Shailendra K. (1Division of Genetics, ICAR-IARI, New Delhi, India)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 836030  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： パンコムギ(Triticum aestivum L.;Ta)は,世界の人口の大部分のための主穀類作物である。偏性真菌病原体,Puccinia triticina L.に起因する葉さび病病は,有意な経済的収量損傷を引き起こす生物栄養病原体である。病原性感染に応答した種々の種類の活性酸素種(ROS)および反応性窒素種(RNS)によって引き起こされる細胞の酸化還元ホメオスタシスの変化は,酸化還元調節因子によって制御される。チオレドキシン(Trx)は低分子量の酸化還元調節因子の一つであり,熱安定性である。ゲノムワイドアプローチを通して,42(42)コムギTrx遺伝子(TaTrx)を,それぞれ12,16および14Trx遺伝子を含むコムギ染色体群A,BおよびDゲノムにわたって同定した。in silico発現分析に基づいて,15のTaTrx遺伝子を選択し,更なる実験に利用した。これらの15の遺伝子は,系統発生分析によって6つの群にクラスタ化された。マイクロRNA(miRNA)標的分析は,8つの異なるmiRNA標的TaTrx遺伝子を明らかにした。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)分析は,TaTrx蛋白質がチオレドキシンレダクターゼ,ペルオキシレドキシンおよび未特性化蛋白質と相互作用することを示した。定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)による発現プロファイルは,4つのTaTrx遺伝子(TaTrx11-5A,TaTrx13-5B,TaTrx14-5D,TaTrx15-3B)が,葉さび病感染に応答して有意に誘導されたことを明らかにした。ROSの局在化とその含有量推定と抗酸化酵素と発現分析のアッセイは,Trxが,さび病耐性の間,スパン24HAI-72HAIでのROSホメオスタシスに関与することを示唆した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  *コムギ ,  葉 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  酸化還元反応 ,  病原性 ,  ホメオスタシス ,  ペルオキシダーゼ ,  病原体 ,  *さび病 ,  *チオレドキシン
準シソーラス用語： ペルオキシレドキシン ,  調節因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コムギ ,  赤さび病 ,  チオレドキシン ,  活性酸素種(ROS) ,  全ゲノム解析

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  麦  (FC03033M)

引用文献 (85件)：

• ApelK., HirtH. (2004). Reactive Oxygen Species: Metabolism, Oxidative Stress, and Signal Transduction. Annu. Rev. Plant Biol. 55, 373-399. doi: 10.1146/annurev.arplant.55.031903.141701
• AudainE., RamosY., HermjakobH., FlowerD. R., Perez-RiverolY. (2016). Accurate Estimation of Isoelectric point of Protein and Peptide Based on Amino Acid Sequences. Bioinformatics 32, 821-827. doi: 10.1093/bioinformatics/btv674
• BaileyT. L., BodenM., BuskeF. A., FrithM., GrantC. E., ClementiL., et al (2009). MEME SUITE: Tools for Motif Discovery and Searching. Nucleic Acids Res. 37 (Suppl. l_2), W202-W208. doi: 10.1093/nar/gkp335
• BaileyT. L., ElkanC., et al (1994). Fitting a Mixture Model by Expectation Maximization to Discover Motifs in Bipolymers. UCSD Technical Report CS94-351. doi: 10.1093/nar/gkp335
• BaxterA., MittlerR., SuzukiN. (2014). ROS as Key Players in Plant Stress Signalling. J. Exp. Bot. 65, 1229-1240. doi: 10.1093/jxb/ert375

タイトルに関連する用語 (10件)： チオレドキシン ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析 ,  コムギ ,  Triticum ,  赤さび病 ,  抵抗性 ,  役割