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J-GLOBAL ID：202202223786866189   整理番号：22A1152129

イタリア北部で育成した2つの近接した自生牛品種のゲノムに存在する選択のシグネチャーと,そのコートカラーとの区別【JST・京大機械翻訳】

Signatures of selection are present in the genome of two close autochthonous cattle breeds raised in the North of Italy and mainly distinguished for their coat colours

著者 (10件)： Bertolini Francesca (National Institute of Aquatic Resources, Technical University of Denmark, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Moscatelli Giulia (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Schiavo Giuseppina (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Bovo Samuele (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Ribani Anisa (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Ballan Mohamad (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Bonacini Massimo (Associazione Nazionale Allevatori Bovini di Razza Reggiana (ANABORARE), Reggio Emilia, Italy) ,  Prandi Marco (Associazione Nazionale Allevatori Bovini di Razza Reggiana (ANABORARE), Reggio Emilia, Italy) ,  Dall’Olio Stefania (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Fontanesi Luca (Division of Animal Sciences, Department of Agricultural and Food Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy)
資料名： Journal of Animal Breeding and Genetics  (Journal of Animal Breeding and Genetics)
巻： 139  号： 3  ページ： 307-319  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1732A  ISSN： 0931-2668  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 自食性ウシ品種は,多くの場合,これらの品種特異的形質に影響する遺伝的機構を理解するのに有用な遺伝性の外部表現型に固定されている遺伝資源である。ReggianaとModeneseは,イタリア北部において,よく知られた原産地において,主に産地する2つの密接に関連する原地性ウシ品種である。”その2つの近縁原産牛品種”は,主に,イタリアの北において,原産地の生産地域において,主に上昇した2つの近縁原産牛品種である。これらの品種は,主にそれらの標準コート色,Reggianaにおける固体赤,およびモデネにおける灰色の淡色陰影を有する固体白色で識別できる。本研究では,GeneSeek GGPウシ150k単一ヌクレオチド多型(SNP)チップをReggiana(n=1109およびモデネス(n=326)の現存ウシ集団のほぼ半分)で遺伝子型決定して,比較F_ST解析におけるゲノムワイド情報を用いて,これら2つの原地性品種の間で分岐する選択のシグネチャを検出した。2つの品種は多次元スケーリングプロットと混和分析を用いて明確に識別できた。トップ0.0005%F_ST値を考慮して,合計64のマーカーを単一マーカー分析で検出した。トップF_ST値をメラノコルチン1受容体(MC1R)遺伝子変異に対して検出し,Reggiana品種の赤色被覆色を決定した。もう一つのコート色遺伝子,アグチーチシグナル伝達蛋白質(ASIP)は,トップSNPのこのリストの間で出現した。これらの結果は,0.5-Mbまたは1-Mbゲノム領域を含む窓に基づく解析でも確認された。ASIPに影響する可変性はヒツジとヤギの白皮色と関連するので,これらの結果は,この遺伝子がモデネ種品種における被覆色に影響する強い候補としてこの遺伝子を強調した。本研究は,局所遺伝資源間の多様性から利点を取るように設計した集団ゲノム手法が,ウシにおいてまだ完全には調査されていない外形質を説明する興味深いヒントを提供できることを示した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 被覆 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  受容体 ,  タンパク質 ,  表現型 ,  *ゲノム ,  *品種 ,  原地性 ,  高次元 ,  遺伝資源 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 原産地 ,  産地 ,  遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bos taurus ,  コートカラー ,  遺伝資源 ,  ゲノム ,  集団ゲノミクス

分類 (2件)： 飼育動物の育種  (FD01020R) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (8件)： イタリア ,  自生 ,  牛 ,  品種 ,  ゲノム ,  シグネチャー ,  コート ,  カラー