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J-GLOBAL ID：202202224166278291   整理番号：22A0842160

調節不全免疫LncRNAに基づく頭頸部扁平上皮癌における分子サブタイプの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Molecular Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Based on Dysregulated Immune LncRNAs

著者 (5件)： Du Yucong (Department of Otorhinolaryngology-Head & Neck Surgery, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200003, China) ,  Ji Zhenhua (Department of Otorhinolaryngology-Head & Neck Surgery, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200003, China) ,  Liao Jianchun (Department of Otorhinolaryngology-Head & Neck Surgery, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200003, China) ,  Liu Huanhai (Department of Otorhinolaryngology-Head & Neck Surgery, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200003, China) ,  Peng Hu (Department of Otorhinolaryngology-Head & Neck Surgery, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200003, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長い非コードRNA(lncRNA)は癌病理において不可欠な機能を実行し,多発性癌の発症と進行に関与する。多重プラットフォームを,分子サブタイプを決定するために頭頚部扁平上皮癌(HNSCC)を包括的に分析するために実行した。分子サブタイプをクラスタ化し,「ConsenusclusterPlus」Rパッケージによって分析した。Limmaソフトウェアを用いて,差次的発現遺伝子(DEG)をスクリーニングした。遺伝子セット濃縮分析(GSEA),遺伝子およびゲノム(KEGG)の京都エンシクロペディア,および遺伝子オントロジー(GO)を含む機能的濃縮分析を3つのデータベース資源で実施した。17のlncRNAを,調節不全であるHNSCC特異的免疫lncRNAとして測定した。本研究では,2つの異なる分子サブタイプ,C1(230試料)およびC2(269試料)を同定し,再定義した。さらに,C1サブタイプはHNSCC試料においてC2サブタイプより高い生存率を有し,また活性化免疫応答による生存期間中央値を延長した。529の上方制御された遺伝子と1002の下方制御された遺伝子を含む1531のDEGを,上記の2つのサブタイプにおいて同定した。機能的濃縮分析は,C2の上方制御された遺伝子が腫瘍形成と発生と関連し,一方,C2の下方制御された遺伝子が免疫応答と関係していることを明らかにした。既存の免疫表現型群と比較して,C1は既存の非定型およびBasalとより重複し,C2および古典的およびMesenchymalは高い一致度を有することを見出した。lncRNAに基づいて,HNSCCの2つの同定された分子サブタイプにおける予後と免疫学的特徴の側面に有意差があった。Copyright 2022 Yucong Du et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  クラスタ化 ,  生存率 ,  ソフトウェア ,  予後 ,  病理 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  オントロジー
準シソーラス用語： 非翻訳RNA ,  遺伝子オントロジー ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  耳・鼻・咽頭・喉頭の腫よう  (GQ04000E)

引用文献 (32件)：

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• P. Bayo, A. Jou, A. Stenzinger, C. Shao, M. Gross, A. Jensen, N. Grabe, C. H. Mende, P. V. Rados, J. Debus, W. Weichert, P. K. Plinkert, P. Lichter, K. Freier, J. Hess, "Loss of SOX2 expression induces cell motility via vimentin up-regulation and is an unfavorable risk factor for survival of head and neck squamous cell carcinoma," Molecular Oncology, vol. 9, no. 8, pp. 1704-1719, 2015.
• L. Mukdad, T. E. Heineman, J. Alonso, K. W. Badran, E. C. Kuan, M. A. John, "Oral tongue squamous cell carcinoma survival as stratified by age and sex: a surveillance, epidemiology, and end results analysis," The Laryngoscope, vol. 129, no. 9, pp. 2076-2081, 2019.
• S. Marur, A. A. Forastiere, "Head and neck squamous cell carcinoma: update on epidemiology, diagnosis, and treatment," Mayo Clinic Proceedings, vol. 91, no. 3, pp. 386-396, 2016.
• R.-W. Yao, Y. Wang, L.-L. Chen, "Cellular functions of long noncoding RNAs," Nature Cell Biology, vol. 21, no. 5, pp. 542-551, 2019.

タイトルに関連する用語 (8件)： 調節 ,  免疫 ,  lncRNA ,  頭頸部扁平上皮癌 ,  分子 ,  サブ ,  タイプ ,  同定