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J-GLOBAL ID：202202224457306986   整理番号：22A1085009

コムギ遺伝子移入系統におけるAmblyopyrum muticumセグメントを検出するための染色体特異的KASPマーカー【JST・京大機械翻訳】

Chromosome-specific KASP markers for detecting Amblyopyrum muticum segments in wheat introgression lines

著者 (12件)： Grewal Surbhi (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK) ,  Coombes Benedict (Earlham Institute, Norwich Research Park, Norwich, UK) ,  Joynson Ryan (Earlham Institute, Norwich Research Park, Norwich, UK) ,  Joynson Ryan (Current address: Limagrain Europe, Clermont-Ferrand, France) ,  Hall Anthony (Earlham Institute, Norwich Research Park, Norwich, UK) ,  Fellers John (USDA-ARS, Hard Winter Wheat Genetics Research Unit, Manhattan, KS, USA) ,  Yang Cai-yun (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK) ,  Scholefield Duncan (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK) ,  Ashling Stephen (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK) ,  Isaac Peter (iDna Genetics Ltd., Norwich Research Park, Norwich, UK) ,  King Ian P. (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK) ,  King Julie (Nottingham BBSRC Wheat Research Centre, School of Biosciences, Univ. of Nottingham, Loughborough, UK)
資料名： Plant Genome  (Plant Genome)
巻： 15  号： 1  ページ： e20193  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5739A  ISSN： 1940-3372  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの野生近縁種は,コムギ(Triticum aestivum L.)の遺伝的多様性を増加させるために,育種前プログラムで使用されている。単一ヌクレオチド多型(SNP)に基づく配列および分子マーカーのような遺伝子型決定ツールは,コムギ-野生相対的遺伝子移入系統を特徴づけるために広く使用されてきた。しかし,レシピエントコムギゲノムの倍数性により,野生種からの移入を追跡するために共優性であるSNPに基づくKompetitive対立遺伝子特異的ポリメラーゼ連鎖反応(KASP)マーカーを開発することは難しい。KASPマーカーを開発する以前の試みは,野生種のエキソームおよびポリメラーゼ連鎖反応(PCR)-アンプリコンに基づく配列決定の両方を含む。しかし,染色体特異的KASPアッセイは,コムギゲノム内の相同SNPにより妨げられてきた。本研究は,2倍体コムギ野生相対Amblyopyrummuticum(Boiss.)Eigの全ゲノム配列決定と,ユニークなコムギゲノム配列における38000SNPsを生成するde novo SNP発見パイプラインの開発を含む。Am.muticum多型KASPマーカーの密度を増加させる新しいアッセイを設計した。60Mbp当たり1マーカーの目標で,335の新しいKASPアッセイをコムギバックグラウンドにおけるAm.muticumの診断として検証した。以前の研究で検証されたアッセイと共に,498の良く分布した染色体特異的マーカーを用いて,以前に遺伝子型のコムギ-Am.muticum倍加半数体(DH)の遺伝子移入系統を再特性化した。KASPマーカーの染色体特異的性質により,コムギ染色体が組換え事象に関与するか,またはAm.muticum染色体で置換され,マーカーの高密度がこれらのDH系統における新しい小侵入の検出を可能にした。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *染色体 ,  *コムギ ,  ヌクレオチド配列 ,  育種 ,  生物分類 ,  対立遺伝子 ,  二倍体 ,  *遺伝子導入 ,  PCR法 ,  倍加半数体 ,  バイオマーカー ,  一塩基多型
準シソーラス用語： アンプリコン ,  分子マーカー ,  ゲノム配列 ,  近縁種 ,  野生種 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： コムギ ,  遺伝子移入 ,  系統 ,  セグメント ,  染色体 ,  マーカー