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J-GLOBAL ID：202202224473877937   整理番号：22A1025192

ヒト結腸直腸癌の予後および免疫特性を予測する新規免疫関連mRNAシグネチャーの構築【JST・京大機械翻訳】

Construction of a Novel Immune-Related mRNA Signature to Predict the Prognosis and Immune Characteristics of Human Colorectal Cancer

著者 (7件)： Li Jianxin (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Han Ting (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Wang Xin (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Wang Yinchun (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Chen Xuan (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Chen Wangsheng (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Yang Qingqiang (Department of General Surgery (Gastrointestinal Surgery), the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 851373  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:抗癌免疫療法アプローチは,複数の癌型において有意な有効性を獲得した。しかし,結腸直腸癌(CRC)の全ての患者は,腫瘍不均一性のため免疫療法から利益を得ることができなかった。本研究の目的は,CRCの免疫特性と予後を予測するための免疫関連シグネチャを構築することであった。【方法】CRC患者のRNA配列データおよび対応する臨床情報を,癌ゲノムアトラス(TCGA)および遺伝子発現Omnibus(GEO)から得て,免疫関連遺伝子(IRG)を,免疫学データベースおよび分析ポート(ImmPort)からダウンロードした。次に,単変量,lasso回帰および多変量cox回帰を用いて,予後IRGを同定し,免疫関連シグネチャを開発した。続いて,ノモグラムを署名および他の予後因子に基づいて確立し,その予測能力を受信者動作特性(ROC)および決定曲線分析(DCA)により評価した。最後に,CRCのシグネチャと免疫特性の間の関連を評価した。結果:TCGAからダウンロードした472試料を訓練コホート(236試料)と内部検証コホート(236試料)に分割し,GEOコホートを外部検証コホート(122試料)としてダウンロードした。全部で476の異なるIRGが同定され,そのうち17がCRC患者の予後と有意に相関していた。最後に,リスクスコア署名を構築するために10のIRGを濾過し,訓練コホートにおけるリスクスコアの中央値に従って,患者を低リスク群と高リスク群に分けた。高リスクスコアは,CRC患者における好ましくない生存転帰および悪性臨床病理学的特徴と有意に相関し,結果は,内部検証コホート,全TCGAコホートおよび外部検証コホートで更に確認された。免疫浸潤分析は,ハイリスク群と比較し,低リスク群の患者が,高い腫瘍浸潤免疫細胞(TIIC)量で浸潤したことを明らかにした。さらに,免疫チェックポイントバイオマーカーは,低リスク群で有意に過剰発現した。結論:IRGにより確立された予後シグネチャは,ヒトCRCの予後と免疫特性を予測する有望な臨床的価値を示し,個別化治療決定に寄与する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  浸潤 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  ヒト ,  因子 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  腫瘍浸潤 ,  *結腸腫瘍 ,  *直腸腫瘍 ,  個別化医療
準シソーラス用語： 予後因子 ,  免疫細胞 ,  *結腸直腸癌 ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 結腸直腸癌 ,  免疫 ,  mRNA ,  予後 ,  免疫療法

分類 (1件)： 消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (57件)：

• AklM. R., NagpalP., AyoubN. M., TaiB., PrabhuS. A., CapacC. M., et al (2016). Molecular and Clinical Significance of Fibroblast Growth Factor 2 (FGF2 /bFGF) in Malignancies of Solid and Hematological Cancers for Personalized Therapies. Oncotarget 7 (28), 44735-44762. doi: 10.18632/oncotarget.8203
• BauerT., TrumpS., IshaqueN., ThürmannL., GuL., BauerM., et al (2016). Environment-induced Epigenetic Reprogramming in Genomic Regulatory Elements in Smoking Mothers and Their Children. Mol. Syst. Biol. 12 (3), 861. doi: 10.15252/msb.20156520
• BaviskarT., MominM., LiuJ., GuoB., BhattL. (2021). Target Genetic Abnormalities for the Treatment of Colon Cancer and its Progression to Metastasis. Curr. Drug Targets. 22 (7), 722-733. doi: 10.2174/1389450121666201119141015
• BethmannD., FengZ., FoxB. A. (2017). Immunoprofiling as a Predictor of Patient's Response to Cancer Therapy-Promises and Challenges. Curr. Opin. Immunol. 45, 60-72. doi: 10.1016/j.coi.2017.01.005
• BhattacharyaS., AndorfS., GomesL., DunnP., SchaeferH., PontiusJ., et al (2014). ImmPort: Disseminating Data to the Public for the Future of Immunology. Immunol. Res. 58 (2-3), 234-239. doi: 10.1007/s12026-014-8516-1

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒト ,  結腸直腸癌 ,  予後 ,  免疫 ,  予測 ,  mRNA ,  シグネチャー ,  構築