Jasminum sambacの高品質ゲノム集合は花形質形成およびOleaceaeゲノム進化への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Xu Shixiao; Xu Shixiao; Xu Shixiao; Ding Yongle; Ding Yongle; Ding Yongle; Sun Juntao; Sun Juntao; Sun Juntao; Zhang Zhiqiang; Zhang Zhiqiang; Zhang Zhiqiang; Wu Zhaoyun; Wu Zhaoyun; Wu Zhaoyun; Yang Tiezhao; Shen Fei; Xue Gang; Xue Gang; Xue Gang

文献

J-GLOBAL ID：202202225873824511 整理番号：22A0415146

Jasminum sambacの高品質ゲノム集合は花形質形成およびOleaceaeゲノム進化への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

A high-quality genome assembly of Jasminum sambac provides insight into floral trait formation and Oleaceae genome evolution

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資料名：
巻： 22 号： 2 ページ： 724-739 発行年： 2022年
JST資料番号： W2685A ISSN： 1755-098X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

最も経済的に重要なOleaceaeファミリーメンバーの1つとして,Jasminum sambacは,その明確な甘い,ヘッキーの香りのために有名である。Illumina読取,ナノポア長読取およびHiC配列決定を用いて,J.sambacゲノムを効率的に組み立て,注釈付けした。高品質ゲノムアセンブリは,13の偽分子を有する合計507Mb配列(コンティグN50=17.6Mb)から成った。合計21,143の蛋白質コード遺伝子と303Mbの反復配列を予測した。Oleaceae(~66百万年前[Ma],後期白亜紀)の基部における古代全ゲノム三重複製事象を同定し,これはOleaceaeの祖先の多様化とLamialesからのその発散に寄与している可能性がある。ストレス関連(例えばWRKY)と開花関連(例えばMADS-box)遺伝子は3重領域に位置し,倍数性事象が適応能に寄与している可能性があることを示唆した。例えば,FTAとTPSのテルペノイド生合成に関連する遺伝子は,J.sambacゲノムで大きな程度に複製され,おそらく花の強い香りを説明することが観察された。J.sambacゲノムにおいて,MADSボックスファミリーの異なる系統発生クレードにおけるコピー数変化が観察され,例えばAGL6およびMαは失われ,SOC拡張,J.sambacの長い開花期間の基礎となる可能性がある特徴であった。アントシアニン生合成に関与する構造遺伝子は枯渇し,これはジャスミンにおける鮮明な色の欠如を説明するかもしれない。まとめると,J.sambacゲノムの組み立てはOleaceaeファミリーのゲノム進化に新しい洞察を提供し,花特性への機構的洞察を提供する。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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