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J-GLOBAL ID：202202226184671981   整理番号：22A1177554

1985~2020年の中国におけるトリコロナウイルス伝染性気管支炎ウイルスの完全ゲノム配列の系統発生および時空間解析:多重伝達鎖の共存とLX4型ウイルスの起源【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic and Spatiotemporal Analyses of the Complete Genome Sequences of Avian Coronavirus Infectious Bronchitis Virus in China During 1985-2020: Revealing Coexistence of Multiple Transmission Chains and the Origin of LX4-Type Virus

著者 (13件)： Fan Wensheng (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Chen Jiming (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Zhang Yu (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Deng Qiaomu (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Wei Lanping (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Zhao Changrun (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Lv Di (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Lin Liting (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Zhang Bingsha (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Wei Tianchao (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Huang Teng (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Wei Ping (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China) ,  Mo Meilan (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 693196  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 伝染性気管支炎(IB)ウイルス(IBV)は家禽生産にかなりの経済的損失を引き起こす。中国におけるIBVの伝送動力学に関するデータは限られている。1985~2020年の間の中国における212のIBV分離株の完全なゲノム配列を,系統樹,組換え事象,dN/dS比,時間的動態,および系統地理学的関係の特性と同様に分析した。LX4型(GI-19)は最も高いdN/dS比を有し,1999年以降最も優勢な遺伝子型であり,台湾-I型(GI-7)と新型(GVI-1)は増加傾向を示した。全部で59の組換え体を同定し,野外とワクチン株間の多重組換え事象が24分離株で見出され,4/91型(GI-13)分離株が組換えに関与する傾向があることを見出した。ベイジアン系統地理学的分析は,中国のIBVが初期1900年代に遼寧省から発することを示唆した。LX4型ウイルスは1950年代後期に遼寧省に遡って,世界における中国と2つの主要な伝染経路において多重伝送経路を持った。ウイルス系統地理学は,中国,北中国(Heilongjiang,遼寧省,吉林),北と中部中国(北京,河北省,山西省,山東と江蘇)と南中国(GuangxiとGuangdong)のIBVs(LX4型を含む)の3つの拡散領域を同定した。山東は,中国におけるIBVs(LX4型を含む)の疫学的センターであった。全体として,本研究は,LX4型ウイルスが主要な遺伝子型とその起源と伝達経路になった理由を明らかにし,中国におけるIBの予防と制御のためのより標的戦略を提供した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ウイルス ,  遺伝子型 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *中華人民共和国 ,  系統樹 ,  *系統発生 ,  *多重化 ,  組換 ,  *コロナウイルス科 ,  感染経路 ,  疫学 ,  *伝染性気管支炎
準シソーラス用語： *伝染性気管支炎ウイルス ,  *ゲノム配列 ,  河北省 ,  ワクチン株 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 伝染性気管支炎ウイルス ,  組換え ,  選択圧力 ,  Bayes系統発生学 ,  ウイルス系統動力学 ,  空間伝送

分類 (2件)： ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R) ,  鶏  (FD03020F)

引用文献 (61件)：

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• Bande F., Arshad S. S., Omar A. R., Hair-Bejo M., Mahmuda A., Nair V. (2017). Global distributions and strain diversity of avian infectious bronchitis virus: a review. Anim Health Res. Rev. 18 70-83. doi: 10.1017/S1466252317000044
• Bielejec F., Baele G., Vrancken B., Suchard M. A., Rambaut A., Lemey P. (2016). SpreaD3: interactive visualization of spatiotemporal history and trait evolutionary processes. Mol. Bio. Evol. 33 2167-2169. doi: 10.1093/molbev/msw082
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• Breban R., Riou J., Fontanet A. (2013). Interhuman transmissibility of Middle East respiratory syndrome coronavirus: estimation of pandemic risk. Lancet 382 694-699. doi: 10.1016/S0140-6736(13)61492-0

タイトルに関連する用語 (11件)： 中国 ,  トリ ,  コロナウイルス ,  伝染性気管支炎ウイルス ,  ゲノム配列 ,  系統発生 ,  時空間解析 ,  多重 ,  共存 ,  ウイルス ,  起源