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J-GLOBAL ID：202202226620795557   整理番号：22A1020052

バイオインフォマティクスと実験的アプローチを用いた遅発性アルツハイマー病におけるBCAS4/hsa-miR-185-5p/SHISA7競合内因性RNAAxisの同定と解析【JST・京大機械翻訳】

Identification and Analysis of BCAS4/hsa-miR-185-5p/SHISA7 Competing Endogenous RNA Axis in Late-Onset Alzheimer’s Disease Using Bioinformatic and Experimental Approaches

著者 (14件)： Sabaie Hani (Clinical Research Development Unit of Tabriz Valiasr Hospital, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Sabaie Hani (Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Talebi Mahnaz (Neurosciences Research Center (NSRC), Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Gharesouarn Jalal (Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Asadi Mohammad Reza (Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Jalaiei Abbas (Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Arsang-Jang Shahram (Cancer Gene Therapy Research Center, Zanjan University of Medical Sciences, Zanjan, Iran) ,  Hussen Bashdar Mahmud (Department of Pharmacognosy, College of Pharmacy, Hawler Medical University, Erbil, Iraq) ,  Hussen Bashdar Mahmud (Center of Research and Strategic Studies, Lebanese French University, Erbil, Iraq) ,  Taheri Mohammad (Institute of Human Genetics, Jena University Hospital, Jena, Germany) ,  Jalili Khoshnoud Reza (Skull Base Research Center, Loghman Hakim Hospital, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Jalili Khoshnoud Reza (Functional Neurosurgery Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Rezazadeh Maryam (Clinical Research Development Unit of Tabriz Valiasr Hospital, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran) ,  Rezazadeh Maryam (Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran)
資料名： Frontiers in Aging Neuroscience (Web)  (Frontiers in Aging Neuroscience (Web))
巻： 14  ページ： 812169  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7056A  ISSN： 1663-4365  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Alzheimer病(AD)は世界的に有病率上昇を伴う不均一な変性脳障害である。SHISA7(CKAMP59)は,他のCKAMP対応物とは異なり,SHISAファミリーの最も興味深い新しいメンバーの1つとして出現し,阻害シナプスGABAAR調節で直接機能を示す。本研究では,タウ病因におけるBCAS4およびSHISA7の競合内因性RNA(ceRNA)調節およびADにおける異常な炎症反応に関連する末梢バイオマーカーとしてのそれらの能力を探索するために,バイオインフォマティクスおよび実験方法を使用した。遺伝子発現Omnibusデータベースは,側頭皮質(TC)組織標本において異なる程度のAD関連神経原線維病理学を有するADを有する個体からのmRNA(GSE106241)とmiRNA(GSE157239)に関する情報を含む2つのマイクロアレイデータセットを含み,対応する対照は遺伝子発現Omnibusデータベースからダウンロードした。Rソフトウェアのlimmaパッケージを用いて,AD関連神経原線維病理に関連した異なる発現mRNA(DEmRNA)とmiRNA(DEmiRNAs)を同定した。さらに,定量的ポリメラーゼ連鎖反応法を用いて,AD患者50名および対照被験者50名の末梢血(PB)におけるBCAS4/hsa-miR-185-5p/SHISA7 ceRNA軸の発現を調べた。BCAS4は,著者らのバイオインフォマティクス研究に基づき,hsa-miR-185-5pのスポンジングにより,TC組織標本におけるAD関連神経原線維病理を通してSHISA7発現を制御するceRNAとして作用することを示した。さらに,ADおよび正常対照に罹患した個人からのPB標本では,BCAS4発現パターンに実質的な違いは見られなかった。AD患者のPBにおけるSHISA7発現は,TCにおける症例と同様に減少した。一方,著者らは,TC組織と異なり,AD患者のPB試料でhsa-miR-185-5pの減少した量を発見し,それは過剰発現していることが示された。BCAS4とSHISA7発現レベルは,強い正の相関を示し,PB標本間のceRNA調節の結果として,相互接続ネットワークの存在を示唆した。本研究は,AD患者の脳とPBにおけるBCAS4/miR-185-5p/SHISA7 ceRNA軸の発現を強調する最初の証拠であり,AD病原性機構の基礎となる分子過程に関する新たな視点を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  シナプス ,  ソフトウェア ,  遺伝子発現 ,  *Alzheimer病 ,  病理 ,  バイオマーカー ,  末梢血 ,  病因
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *バイオインフォマティクス ,  *内因性 ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アルツハイマー病 ,  BCAS4 ,  競合する内因性RNA ,  miR-185 ,  SHISA7

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (54件)：

• Akiyama H., Barger S., Barnum S., Bradt B., Bauer J., Cole G. M., et al (2000). Inflammation and Alzheimer’s disease. Neurobiol. Aging. 21 383-421.
• Association A. P. (2013). Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSM-5®). Washington: American Psychiatric Pub.
• Bärlund M., Monni O., Weaver J. D., Kauraniemi P., Sauter G., Heiskanen M., et al (2002). Cloning of BCAS3 (17q23) and BCAS4 (20q13) genes that undergo amplification, overexpression, and fusion in breast cancer. Genes Chromosomes Cancer 35 311-317. doi: 10.1002/gcc.10121
• Braak H., Braak E. (1991). Neuropathological stageing of Alzheimer-related changes. Acta Neuropathol. 82 239-259. doi: 10.1007/BF00308809
• Busche M. A., Hyman B. T. (2020). Synergy between amyloid-β and tau in Alzheimer’s disease. Nat. Neurosci. 23 1183-1193. doi: 10.1007/BF00308809

タイトルに関連する用語 (8件)： バイオインフォマティクス ,  実験 ,  遅発性 ,  アルツハイマー病 ,  競合 ,  内因性 ,  同定 ,  解析