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J-GLOBAL ID:202202227134432886   整理番号:22A1139942

TXNDC11遺伝子による汎癌の予後評価価値とその免疫調節作用のバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis on prognostic evaluation value of TXNDC11 gene in pan-cancer and its immunity regulation
著者 (3件):
資料名:
巻: 48  号:ページ: 142-153  発行年: 2022年 
JST資料番号: C2934A  ISSN: 1671-587X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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目的:バイオインフォマティクス方法を通じて、チオレドキシンドメイン11(TXNDC11)の汎癌予後分析における作用及び腫瘍免疫細胞浸潤との関係を検討し、腫瘍の予後評価価値を検討する。方法;ONCOMINEとTIMERデータベースを用いて、TXNDC11mRNAとタンパク質が腫瘍組織及び対応する癌周辺正常組織に総合的に分析された。腫瘍組織と正常組織の間のTXNDC11蛋白質の発現を,臨床プロテオーム分析(CPTAC)データベースによって分析した。遺伝子発現プロファイル相互作用分析(GEPIA)を用いて,TXNDC11発現と汎癌病期の間の相関関係を分析した。Kaplan-MeierPlotterオンラインウェブサイトを用いて、TXNDC11の発現と汎癌患者の生存予後との関係を分析した。TIMERデータベースを用いて、各種腫瘍組織におけるTXNDC11タンパク質の発現と腫瘍免疫浸潤細胞との相関性を分析した。SangerBoxデータベースを用いて、TXNDC11タンパク質と免疫検査点との関係を分析した。結果;ONCOMINEデータベースの分析は,正常組織と比較して,結腸癌(COAD),胃腺癌(STAD)および肉腫(SARC)におけるTXNDC11mRNA発現レベルが,明らかに減少した(P<0.05)、乳癌(BRCA)、食道癌(ESCA)、腎嫌色細胞癌(KICH)と膵臓癌(PAAD)組織中のTXNDC11mRNA発現レベルは明らかに上昇(P<0.01)。TIMERデータベース分析では、BRCA、胆管癌(CHOL)、ESCA、膠芽細胞腫(GBM)、頭頸部扁平上皮癌(HNSC)と前立腺癌(PRAD)組織中のTXNDC11タンパク発現レベルが上昇し、COAD、CKC1の発現レベルが上昇した。腎乳頭細胞癌(KIRP)、肺腺癌(LUAD)、肺扁平上皮癌(LUSC)、褐色細胞腫と傍神経節腫(PCPG)、直腸腺癌(READ)と甲状腺癌(THCA)組織中のTXNDC11は明らかに低い発現を示した。CPTACデータベース分析によると、腎明細胞癌(KIRC)と子宮内膜癌(UCEC)組織中のTXNDC11タンパク発現は癌周囲正常組織より明らかに高かった(P<0.01)、BRCA、卵巣癌(OV)とCOAD組織中のTXNDC11タンパク質の発現レベルは、癌周辺正常組織(P<)より明らかに低かった。0.05またはP<0.01)。GEPIAデータベース分析によると、TXNDC11発現レベルはLUAD、卵巣漿液性嚢胞腺癌、THCAとUCEC患者の臨床病理分期と密接に関連する(P<0.05)。Kaplan-MeierPlotterデータベース分析,膀胱尿路上皮癌(BLCA)(HR=0.71,P=0.024),BRCA(HR=0.68,P=0.021),ESCA(HR=0.39,P=0)。0051,HNSC(HR=0.72,P=0.026),KIRC(HR=0.41,P=0.0026),LUAD(HR=0.53,P<0.01),READ(HR=0.34,P=0.014),SARC(HR=0.61,P=0.016),胸腺癌(THYM)(HR=0.14,P=0.0042),THCA(HR=0.35,P=0)。043)とUCEC(HR=0.36,P<0.01)組織におけるTXNDC11の高発現は腫瘍患者の良好な予後と関係がある。TIMERデータベース分析によると、TXNDC11発現は22種類の腫瘍組織におけるB細胞浸潤レベルと相関性がある(P<【結果】CD4+Tリンパ球の浸潤レベル,CD8+Tリンパ球の浸潤レベル,および22の腫瘍組織における好中球の浸潤は,CD4+Tリンパ球の浸潤レベル,TXNDC11発現,およびCD4+Tリンパ球の浸潤レベル,およびCD8+Tリンパ球の浸潤レベル,および,CD4+Tリンパ球の浸潤レベル,および,CD8+Tリンパ球浸潤22種類の腫瘍組織におけるマクロファージ浸潤レベルと23種類の腫瘍組織における樹状細胞浸潤レベルは明らかな相関性(P<0.05);TXNDC11発現はCOAD、LUSC、HNSC、SARCと皮膚黒色腫(SKCM)の免疫細胞と明らかな相関性がある(P<0.01)。SangerBoxデータベース分析によると、TXNDC11は多種の腫瘍組織において、複数の免疫チェックポイントの遺伝子発現レベルと明らかな相関性がある(P<0.05)。結論:汎癌分析において、TXNDC11は多種の腫瘍組織で普遍的に低発現しており、しかもTXNDC11は多種の腫瘍患者の予後生存と密接な関係がある。TXNDC11は重要な腫瘍予後予測因子であり、ある程度多種の腫瘍の免疫反応を調節することができる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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消化器の腫よう  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 

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