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J-GLOBAL ID：202202227215248397   整理番号：22A1039306

骨肉腫のmiRNA-mRNA調節ネットワークにおけるバイオマーカーのスクリーニングと分析【JST・京大機械翻訳】

Screening and Analysis of Biomarkers in the miRNA-mRNA Regulatory Network of Osteosarcoma

著者 (6件)： Han Gang (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China) ,  Guo Quanyi (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China) ,  Li Nan (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China) ,  Bi Wenzhi (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China) ,  Xu Meng (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China) ,  Jia Jinpeng (Department of Orthopedics, The Fourth Medical Center of General Hospital of PLA, Beijing 100048, China)
資料名： Journal of Healthcare Engineering (Web)  (Journal of Healthcare Engineering (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7772A  ISSN： 2040-2295  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫は悪性疾患であり,これらの患者の予後を完全に克服できる有効な戦略はほとんどない。本研究は,公共マイクロアレイデータセットを掘削することによる骨肉腫の主要因子と関連分子機構を明らかにすることを試みた。データは遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースから得た。GSE69470およびGSE12685lにおいて,それぞれ差次的発現miRNAおよび差次的発現遺伝子を得た。miRNAの標的をmiRDIPデータベースで予測した;因子の機能を分析し,DavidデータベースとR言語によってそれぞれ可視化した。さらに,蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークおよびmiRNA-mRNAネットワークを,GSE69470およびGSE12685におけるハブノードを同定するために,STRINGデータベースおよびCytoscapeソフトウェアで実施した。結果は,834のDEGがGSE12685で発見され,37のmiRNAがGSE69470で見つかったことを示した。さらに,37のmiRNAの標的は,PI3K/AKT,P53,Wnt/β-カテニン,およびTGF-β経路で濃縮され,骨格系発達と細胞増殖と関連した。そのうえ,miR-22-3p,miR-154-5p,miR-34a-5p,miR-485-3p,miR-93-5p,およびmiR-9-5pを含むmiRNA,およびLEF1,RUNX2,CSF1R,CDKN1A,およびFBN1を含む遺伝子を,ネットワーク分析によってハブノードとして同定した。結論として,この研究は,miR-22-3p,miR-154-5p,miR-34a-5p,miR-485-3p,miR-93-5pおよびmiR-9-5pを含むmiRNA,およびLEF1,RUNX2,CSF1R,CDKN1A,およびFBN1を含む遺伝子が骨肉腫の進行の鍵となる因子として作用することを示唆した。Copyright 2022 Gang Han et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  可視化 ,  細胞増殖 ,  ソフトウェア ,  *骨肉腫 ,  遺伝子発現 ,  TGFβ ,  *バイオマーカー
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  βカテニン ,  差次的遺伝子発現 ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (30件)：

• Q. Huang, X. Liang, T. Ren, Y. Huang, H. Zhang, Y. Yu, C. Chen, W. Wang, J. Niu, J. Lou, W. Guo, "The role of tumor-associated macrophages in osteosarcoma progression - therapeutic implications," Cellular Oncology, vol. 44, no. 3, pp. 525-539, 2021 Jun.
• K.-H. Lu, E. W.-H. Lu, C.-W. Lin, J.-S. Yang, S.-F. Yang, "New insights into molecular and cellular mechanisms of zoledronate in human osteosarcoma," Pharmacology & Therapeutics, vol. 214, 2020 Oct.
• Y. Liu, N. Huang, S. Liao, E. Rothzerg, F. Yao, Y. Li, D. Wood, J. Xu, "Current research progress in targeted anti-angiogenesis therapy for osteosarcoma," Cell Proliferation, vol. 54, no. 9, 2021 Sep.
• J. Li, Y. Lu, G. Chen, M. Li, X. Xiao, C. Ji, Z. Wang, Z. Guo, "Cryoablation-aided joint retention surgery for epiphysis involvement in osteosarcoma compared with endoprosthetic replacement," The Bone & Joint Journal, vol. 103-B, no. 8, pp. 1421-1427, 2021 Aug.
• M. Heng, A. Gupta, P. W. Chung, J. H. Healey, M. Vaynrub, P. S. Rose, M. T. Houdek, P. P. Lin, A. J. Bishop, F. J. Hornicek, Y.-L. Chen, S. Lozano-Calderon, G. E. Holt, I. Han, D. Biau, X. Niu, N. M. Bernthal, P. C. Ferguson, J. S. Wunder, Japanese Musculoskeletal Oncology Group, Soft Tissue Osteosarcoma International Collaborative, "The role of chemotherapy and radiotherapy in localized extraskeletal osteosarcoma," European Journal of Cancer, vol. 125, pp. 130-141, 2020 Jan.

タイトルに関連する用語 (7件)： 骨肉腫 ,  miRNA ,  mRNA ,  調節ネットワーク ,  バイオマーカー ,  スクリーニング ,  分析