文献

J-GLOBAL ID：202202227422123192   整理番号：22A0845174

第12位置におけるK-Ras置換の突然変異景観-系統的分子動力学アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Mutational landscape of K-Ras substitutions at 12th position-a systematic molecular dynamics approach

著者 (5件)： S Udhaya Kumar. (School of Biosciences and Technology, Vellore Institute of Technology, Vellore, Tamil Nadu, India) ,  R Bithia. (School of Biosciences and Technology, Vellore Institute of Technology, Vellore, Tamil Nadu, India) ,  D Thirumal Kumar. (School of Biosciences and Technology, Vellore Institute of Technology, Vellore, Tamil Nadu, India) ,  Doss C. George Priya (School of Biosciences and Technology, Vellore Institute of Technology, Vellore, Tamil Nadu, India) ,  Zayed Hatem (Department of Biomedical Sciences, College of Health and Sciences, Qatar University, Doha, Qatar)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 4  ページ： 1571-1585  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： K-Rasは,小さなGTPアーゼであり,GEFsとGAPを動員することにより分子スイッチとして作用し,不活性GDP結合と動的GTP結合型の間の代替である。K-Rasの位置12のアミノ酸は発癌性変異(G12A,G12C,G12D,G12R,G12S,G12V)のホットスポットであり,蛋白質の活性折畳みを乱し,癌発生を導く。この研究は,GAPが仲介するGTP加水分解を傷害する,12番目の位置でこれら発癌性変異により誘導される,可能性のある立体配座変化を検討することを目的とした。野生型K-Ras蛋白質の安定性に対するこれらの6つの変異の影響を評価するために,包括的計算ツール(iStable,FoldX,SNP効果,DynaMut,およびCUPSAT)を用いた。K-RasとGTPのドッキングをAutoDock4.2を用いて行い,分子動力学シミュレーションを行った。さらに,野生型K-Rasと6変異体間の結合エネルギーの比較において,G12AとG12V変異体は他の4変異体と比較して最も強い結合効率を示した。これらの変異の軌跡解析は,G12Aが野生型と比較して最小偏差,変動,分子間H結合,およびコンパクト性に遭遇し,それはより低いGibbs自由エネルギー値によって支持されたことを明らかにした。本研究では,癌発生に関与する分子機構に関する洞察を提供し,癌に対する標的化治療のためのプラットフォームとして役立つと思われる12番目の位置で変異体K-Ras型の分子動力学シミュレーションを検討した。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  加水分解 ,  配座転移 ,  アミノ酸 ,  *突然変異 ,  突然変異体 ,  発癌 ,  折畳み ,  GTPアーゼ ,  ホットスポット ,  *分子動力学 ,  野生型 ,  ターゲティング ,  *Rasタンパク質
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： K-Ras ,  癌 ,  突然変異 ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション

分類 (4件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  発癌機序・因子  (GE02020C) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A)

タイトルに関連する用語 (6件)： K-Ras ,  置換 ,  突然変異 ,  景観 ,  系統 ,  分子動力学