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J-GLOBAL ID:202202227498091316   整理番号:22A0922831

空間トランスクリプトームを用いて検出したHPV関連頭頸部扁平上皮癌患者における癌関連線維芽細胞の特異的活性化【JST・京大機械翻訳】

Differential Activation of Cancer-Associated Fibroblasts in HPV-Associated Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Patients Detected Using Spatial Transcriptomics
著者 (14件):
資料名:
巻: 112  号:ページ: e35-e36  発行年: 2022年 
JST資料番号: B0262B  ISSN: 0360-3016  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 短報  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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ヒトパピローマウイルス(HPV)+とHPVヘッドと頚部扁平上皮癌(HNSCC)の腫瘍微小環境(TME)内の癌関連線維芽細胞(CAFs)遺伝子発現を空間的に特性化する。CAF遺伝子発現はHPV+とHPV疾患の間で異なる可能性があり,CAFsは免疫チェックポイント阻害(ICI)に対する腫瘍応答において役割を果たす可能性があると仮定した。腫瘍隣接間質(TAS)と先導腫瘍端(LTE)の空間的トランスクリプトーム解析を用いて,3つの新アジュバンドICI試験のサンプルにおけるCAFsを分析した。患者は,手術前の機会の窓で一次療法として,ニボルマブ(タダラフィルまたはBMS986205)またはデュバルマブ(メトホルミンで)のどちらかを受けた。7人の患者(n=4HPV+,3HPV-)からのペアリング前および後処理試料を分析した。新規CAF-署名遺伝子セットを,確立された文献に基づいて開発し,トランスクリプトーム解析に使用した。「CAFスコア」を用いて,HPV状態および治療への応答に基づく発現パターンを比較した。転写調節パターンはVennPlexを用いて評価した。TASとLTEの教師なしクラスタリングはHPV+とHPV-pre-tx試料における異なるCAF関連発現パターンを示した。HPV+将来の応答者は,CAF関連遺伝子,前処理の増加した活性化を示した。post-tx試料はHPV状態に基づいて明確にクラスターしなかった。TAS区画でのポスト/前処理の比率のVennPlex分析は,11の禁制遺伝子:CD9,EPCAM,ITGB1,FAP,PDPN,CLU,TGRBR1,CD59,FGF7,SLC16A1,およびIL-6を示した。最も禁忌はCD9であり,発現レベルは3.4倍変化した。TASでは,CAFスコアはtx応答者で減少したが,有意ではなかった(p=0.52)。対照的に,非応答者はCAFスコアの有意な増加を示した(p=0.04)。HPV+HNSCCはTASとLTEの両方で異なるCAF遺伝子発現プロファイルを有する。非応答者は,TASにおけるCAF遺伝子転写をアップレギュレートし,ICI治療抵抗性におけるCAFsの可能性のある役割を示し,さらなる研究を正当化した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
腫ようの化学・生化学・病理学 

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