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J-GLOBAL ID：202202227518268239   整理番号：22A1025126

慢性涙嚢炎患者の涙嚢における異なる発現環状RNA【JST・京大機械翻訳】

Differently Expressed Circular RNAs in Lacrimal Sacs From Patients With Chronic Dacryocystitis

著者 (12件)： Li Yue (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Li Yue (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China) ,  Liu Xueru (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Liu Xueru (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China) ,  Zhang Wenyue (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Zhang Wenyue (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China) ,  Song Xuefei (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Song Xuefei (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China) ,  Zhang Leilei (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Zhang Leilei (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China) ,  Xiao Caiwen (1Department of Ophthalmology, School of Medicine, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Xiao Caiwen (2Shanghai Key Laboratory of Orbital Diseases and Ocular Oncology, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 834111  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,異なる発現円形RNA(circRNA)を同定し,慢性涙嚢炎患者由来の涙嚢における潜在的役割を調べた。3つの慢性涙嚢炎患者と3つの対照被験者の涙嚢サンプルを,リボソームRNAが枯渇した後にRNA塩基配列決定のために採取した。異なる発現circRNAとメッセンジャーRNA(mRNA)を共発現解析に用いた。CircRNA-microRNA(miRNA)-mRNA相互作用ネットワークもmiRandaソフトウェアにより確立した。一方,経路および機能的濃縮分析を,circRNA-mRNA共発現ネットワークにおけるダウンおよび上方制御mRNAのために実施した。慢性涙嚢炎と対照試料におけるcircRNAとmRNAの発現レベルを,定量的リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)によって確証した。RNA配列決定により予測された全3,909cirRNAsにおいて,25circRNA(20アップレギュレートおよび5ダウンレギュレーション)は,慢性涙嚢炎試料において異なる発現を示した。さらに,1486の差次的発現mRNAを同定した。これらの異なる発現循環RNAとmRNAのうち,8つはMYH2,DSP,CD27,CCL5,FN1を含むqRT-PCRにより検証され,a_circ_0004792,circ_0001062,およびcirc_015476であった。遺伝子オントロジー(GO)分析は,この共発現ネットワークにおける変化したmRNAの大部分が免疫系過程に関与し,一方,遺伝子およびゲノム(KEGG)分析の京都エンシクロペディアは,これらの変化した発現mRNAが上皮細胞の細菌浸潤でも増幅され,その両方が慢性涙嚢炎の病因に関与すると考えられることを示した。circRNA-miRNA-mRNA相互作用ネットワークにおいて,6つのサーコRNAはTh1とTh2細胞分化に関連し,それは慢性の涙嚢炎の発症と密接に関連することを見出した。本研究は,慢性涙嚢炎患者と対照個人の涙嚢試料のcircRNAとmRNAの間の統計的に有意な差異を同定し,慢性涙嚢炎の病因におけるサーコRNA,miRNA,およびmRNAの調節機構への新規洞察を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ネットワーク ,  細菌 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  ソフトウェア ,  *患者 ,  遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  上皮細胞 ,  病因
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 慢性涙嚢炎 ,  CirRNA ,  競合する内因性RNA ,  RNA配列 ,  病因

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (39件)：

• AliM. J., MulayK., PujariA., NaikM. N. (2013). Derangements of Lacrimal Drainage-Associated Lymphoid Tissue (LDALT) in Human Chronic Dacryocystitis. Ocul. Immunol. Inflamm. 21, 417-423. doi: 10.3109/09273948.2013.797473
• AlsalamahA. K., AlkatanH. M., Al-FakyY. H. (2018). Acute Dacryocystitis Complicated by Orbital Cellulitis and Loss of Vision: A Case Report and Review of the Literature. Int. J. Surg. Case Rep. 50, 130-134. doi: 10.1016/j.ijscr.2018.07.045
• AminR. M., HusseinF. A., IdrissH. F., HanafyN. F., AbdallahD. M. (2013). Pathological, Immunohistochemical and Microbiologicalal Analysis of Lacrimal Sac Biopsies in Patients with Chronic Dacrocystitis. Int. J. Ophthalmol. 6, 817-826. doi: 10.3980/j.issn.2222-3959.2013.06.14
• AvdagicE., PhelpsP. O. (2020). Nasolacrimal Duct Obstruction as an Important Cause of Epiphora. Disease-a-Month 66, 101043. doi: 10.1016/j.disamonth.2020.101043
• BadhuB., DulalS., KumarS., ThakurS. K. D., SoodA., DasH. (2005). Epidemiology of Chronic Dacryocystitis and success Rate of External Dacryocystorhinostomy in Nepal. Orbit 24, 79-82. doi: 10.1080/01676830490916073

タイトルに関連する用語 (6件)： 慢性 ,  涙嚢炎 ,  患者 ,  涙嚢 ,  発現 ,  環状RNA