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J-GLOBAL ID：202202228123338196   整理番号：22A1024157

統合マルチオミクス解析による喉頭扁平上皮癌における免疫浸潤表現型の同定と検証【JST・京大機械翻訳】

Identification and Validation of Immune Infiltration Phenotypes in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma by Integrative Multi-Omics Analysis

著者 (6件)： Yan Li (1Department of Radiation Oncology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Song Xiaole (2Department of Otolaryngology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Yang Gang (1Department of Radiation Oncology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zou Lifen (1Department of Radiation Oncology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhu Yi (1Department of Radiation Oncology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Wang Xiaoshen (1Department of Radiation Oncology, Eye & ENT Hospital, Fudan University, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 843467  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:喉頭扁平上皮癌(LSCC)は,世界で最も一般的な頭頚部癌の1つである。しかし,LSCCの免疫浸潤表現型はよく調べられていない。方法:LSCCのマルチオミクスデータを,TCGA(n=111)とGEO(n=57)データセットから得た。24の免疫細胞集団の浸潤をGSVA法を用いて計算した。次に,異なる免疫細胞浸潤パターンを有するLSCCサンプルをクラスタ化して,マルチオミクス差異を調査した。結果:患者を高浸潤群と低浸潤群に分類した。大部分の免疫細胞の浸潤スコアは,高浸潤群でより高かった。高浸潤表現型の患者は,高いNとTNMステージを有するが,より良い生存と,より少ない変異COL11A1とMUC17を有する。PD1,PDL1,LAG3およびCTLA4のような免疫療法の一般的標的は,高浸潤群において有意に上方制御された。差次的に発現した遺伝子は,主にいくつかの免疫関連GOとKEGG経路に富んでいた。遺伝子,miRNAおよびlncRNAsに基づいて,TCGAおよびGEOコホートの両方で差次的に発現し,BTN3A1,CCR1,miR-149-5pなど,中心に位置するceRNAネットワークを構築した。予測モデルも構築し,16の遺伝子発現値を用いて患者の免疫浸潤表現型を計算し,TCGAとGEOコホートにおいて優れた精度と特異性を示した。結論:本研究では,LSCCの免疫浸潤表現型と対応するマルチオミクス差異を調査した。著者らのモデルは免疫療法の転帰の予測に有用である。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  *浸潤 ,  遺伝子 ,  *喉頭 ,  *表現型 ,  クラスタ化 ,  膜タンパク質 ,  免疫療法 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  アップレギュレーション ,  予測モデル ,  細胞浸潤
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  免疫細胞 ,  LAG3 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 頭頚部癌 ,  喉頭 ,  免疫学 ,  TCGA ,  免疫浸潤

分類 (2件)： 耳・鼻・咽頭・喉頭の腫よう  (GQ04000E) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (29件)：

• Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin (2021) 71:209-49. doi: doi: 10.3322/caac.21660
• Du Y, Shao S, Lv M, Zhu Y, Yan L, Qiao T. Radiotherapy Versus Surgery-Which Is Better for Patients With T1-2n0m0 Glottic Laryngeal Squamous Cell Carcinoma? Individualized Survival Prediction Based on Web-Based Nomograms. Front Oncol (2020) 10:1669. doi: doi: 10.3389/fonc.2020.01669
• Zhan C, Yang X, Song X, Yan L. Radiotherapy vs Surgery for T1-2N0M0 Laryngeal Squamous Cell Carcinoma: A Population-Based and Propensity Score Matching Study. Cancer Med (2018) 7:2837-47. doi: doi: 10.1002/cam4.1525
• Steuer CE, El-Deiry M, Parks JR, Higgins KA, Saba NF. An Update on Larynx Cancer. CA Cancer J Clin (2017) 67:31-50. doi: doi: 10.3322/caac.21386
• Forastiere AA, Ismaila N, Lewin JS, Nathan CA, Adelstein DJ, Eisbruch A, et al. Use of Larynx-Preservation Strategies in the Treatment of Laryngeal Cancer: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline Update. J Clin Oncol (2018) 36:1143-69. doi: doi: 10.1200/JCO.2017.75.7385

タイトルに関連する用語 (8件)： 統合 ,  マルチオミクス解析 ,  喉頭扁平上皮癌 ,  免疫 ,  浸潤 ,  表現型 ,  同定 ,  検証