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J-GLOBAL ID:202202228157453079   整理番号:22A1052045

Tetrameres grusiのミトコンドリアゲノムの特性化およびスピルリナの系統発生への洞察【JST・京大機械翻訳】

Characterization of the mitochondrial genome of Tetrameres grusi and insights into the phylogeny of Spirurina
著者 (13件):
資料名:
巻: 17  ページ: 35-42  発行年: 2022年 
JST資料番号: W2953A  ISSN: 2213-2244  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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Tetrameres grusiはサブオーダーSpirurinaに分類されるクレーンの重要な寄生線虫である。しかし,1世紀以上,この分類は議論の余地がある。ミトコンドリアゲノムは,寄生虫分類学,集団遺伝学および系統的研究にとって貴重な資源である。ここでは,T.grusiのミトコンドリアゲノムを決定し,その後,ミトコンドリア蛋白質コード遺伝子から予測されるアミノ酸配列の連結データセットを用いてSpirurina種からのそれらと比較した。T.grusiの完全なミトコンドリアゲノムは,13,709bpで円形であり,それは12の蛋白質コード遺伝子,22の転送RNA遺伝子,2つのリボソームRNA遺伝子および1つの非コード領域を含んでいる。すべての蛋白質コード遺伝子は,同じ方向に転写される。T.grusiのミトコンドリアゲノムにおいて,1~44bpの18の遺伝子間スペーサーと1bpから28bpの範囲の遺伝子重複を有する6つの位置があった。このミトコンドリアゲノムのAT含有量は71.56%であった。これは他のSpirurina種のミトコンドリアゲノムと類似し,それはまた,ヌクレオチド組成だけでなくコドン使用においても強いAT含有量バイアスを示した。25のSpirurina 線虫類の配列決定されたマイトゲノムは,12の蛋白質コード遺伝子に基づく3つのクラスの遺伝子配列を示し,T.grusiミトコンドリアゲノムの遺伝子配列はクラスIに属した。25のSpirurina 線虫類のミトコンドリアゲノムを用いた系統解析は,T.grusi(Habronmatoidea)がSpirocerca lupi(Therazioidea)よりGongylonema pulchrum(Spiruroidea)に近いことを明らかにした。T.grusiの完全なミトコンドリアゲノム配列の有用性は,Spirurina 線虫類に関するさらなる研究のために新しく有用な遺伝的マーカーを提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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遺伝子の構造と化学 
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