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J-GLOBAL ID：202202228285688566   整理番号：22A0804092

MaSTR:特異的に分解したDNAと関連したSTR混合物の解釈のための効果的な確率的遺伝子型決定ツール【JST・京大機械翻訳】

MaSTR: an effective probabilistic genotyping tool for interpretation of STR mixtures associated with differentially degraded DNA

著者 (6件)： Holland Mitchell M. (Forensic Science Program, Department of Biochemistry & Molecular Biology, 339 Whitmore Laboratory, The Pennsylvania State University, University Park, PA, USA) ,  Tiedge Teresa M. (Department of Population Health and Pathobiology, North Carolina State University, Raleigh, NC, USA) ,  Bender Abigail J. (Texas Department of Public Safety, Austin Crime Laboratory, Austin, TX, USA) ,  Gaston-Sanchez Sidney A. (Armed Forces Medical Examiner System (AFMES), Dover Air Force Base, Dover, DE , USA) ,  Gaston-Sanchez Sidney A. (SNA International, Contractor Supporting the AFMES, Alexandria, VA, USA) ,  McElhoe Jennifer A. (Forensic Science Program, Department of Biochemistry & Molecular Biology, 339 Whitmore Laboratory, The Pennsylvania State University, University Park, PA, USA)
資料名： International Journal of Legal Medicine  (International Journal of Legal Medicine)
巻： 136  号： 2  ページ： 433-446  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0122A  ISSN： 0937-9827  CODEN： IJLMEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近開発した確率的遺伝子タイピングソフトウェアパッケージMaSTR(SoftGenetics LLC)を用いて,DNAの差次的分解源を有する多様な2人STR混合物プロファイルに対する統計的重み推定を開発した。144の2人プロファイルに関する合計864の分析を行った。混合比は,DNAの元の源と人工的に分解されたDNA(150または250bpsの平均サイズフラグメント)の種々の組み合わせを含む1:1から1:10の範囲であった。DNAテンプレートの量を変動(全入力の0.1から0.5ngs)し,MaSTR分析を,尤度比(LR)値を生成する条件付けプロファイルの有無で,10,000または40,000反復の8つの鎖で行った。全体として,ソフトウェアは期待通りに実行した。元の混合物プロファイルに対する得られたlog(LR)値は典型的には1030以上であった。各寄与者に対するΔΨ0.05ngsでのDNA源と関連する低品質混合データは,ピーク不均衡および対立遺伝子ドロップアウトをもたらし,これは,寄与者の支持における重量を減少させた。これは,より高いレベルの分解によって悪化し,いくつかの事例は,排除のサポートにおいてlog(LR)値をもたらした。これらの研究は,法医学調査における確率的遺伝子型決定ソフトウェアソリューションの使用のための付加的サポートを提供し,科学と技術(PCAST)に関するアドバイザーのP.Preshn Communitによって提起された懸念に対処した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  混合比 ,  プログラムパッケージ ,  ソフトウェア ,  対立遺伝子 ,  混合物 ,  法医学 ,  フラグメント
準シソーラス用語： 縦列反復配列 ,  不均衡 ,  尤度比 ,  *遺伝子タイピング ,  DNA分解 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 法医学科学 ,  短いタンデムリピート ,  DNA分解 ,  確率的遺伝子型決定

分類 (2件)： 法医学  (GA03000B) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 分解 ,  DNA ,  STR ,  混合物 ,  確率 ,  遺伝子型決定 ,  ツール