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J-GLOBAL ID：202202228646670186   整理番号：22A1077289

タンパク質折畳みモデルに触発された二色経路埋込み問題

Bicolored Path Embedding Problems Inspired by Protein Folding Models

著者 (3件)： FENG Tianfeng (School of Information Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology (JAIST)) ,  UEHARA Ryuhei (School of Information Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology (JAIST)) ,  VIGLIETTA Giovanni (School of Information Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology (JAIST))
資料名： IEICE Transactions on Information and Systems (Web)  (IEICE Transactions on Information and Systems (Web))
巻： E105.D  号： 3  ページ： 623-633(J-STAGE)  発行年： 2022年 
JST資料番号： U0469A  ISSN： 1745-1361  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,タンパク質折畳みのよく知られた疎水性-親水性(H...

シソーラス用語： *タンパク質 ,...
準シソーラス用語： *タンパク質折畳み

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著者キーワード (5件)： 二色グリッドグラフ ,  埋込み問題 ,  HP(疎水性-極性)モデル ,  ハミルトニアン経路問題 ,  蛋白質折畳み問題

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (23件)：

• [1] E.M. Arkin, S.P. Fekete, K. Islam, H. Meijer, J.S.B. Mitchell, Y. Núñez-Rodríguez, V. Polishchuk, D. Rappaport, and H. Xiao, “Not being (super) thin or solid is hard: A study of grid Hamiltonicity,” Computational Geometry, vol.42, no.6-7, pp.582-605, Aug. 2009. 10.1016/j.comgeo.2008.11.004
• [2] C. Bazgan, B. Escoffier, and V.T. Paschos, “Completeness in standard and differential approximation classes: Poly-(D)APX- and (D)PTAS-completeness,” Theoretical Computer Science, vol.339, no.2-3, pp.272-292, June 2005. 10.1016/j.tcs.2005.03.007
• [3] P.-A. Champin and C. Solnon, “Measuring the similarity of labeled graphs,” Proc. the 5th Int. Conf. Case-Based Reasoning Research and Development (ICCBR'03), pp.80-95, 2003. 10.1007/3-540-45006-8_9
• [4] P. Crescenzi, D. Goldman, C. Papadimitriou, A. Piccolboni, and M. Yannakakis, “On the complexity of protein folding,” J. Computational Biology, vol.5, no.3, pp.423-465, 1998. 10.1089/cmb.1998.5.423
• [5] K.A. Dill, “Theory for the folding and stability of globular proteins,” Biochemistry, vol.24, no.6, pp.1501-1509, March 1985. 10.1021/bi00327a032

タイトルに関連する用語 (5件)： タンパク質折畳み ,  モデル ,  二色 ,  経路 ,  埋込み