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J-GLOBAL ID：202202229623516279   整理番号：22A0890360

神経因性疼痛におけるマイクロRNA代謝遺伝子調節ネットワークのバイオインフォマティクス解析および対応する潜在的治療の予測【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis of the MicroRNA-Metabolic Gene Regulatory Network in Neuropathic Pain and Prediction of Corresponding Potential Therapeutics

著者 (4件)： Zhang Huai-Gen (Department of Anesthesiology, First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, Jiangxi Province, China) ,  Liu Li (Department of Oncology, Jiangxi Provincial People’s Hospital Affiliated To Nanchang University, Nanchang, Jiangxi Province, China) ,  Song Zhi-Ping (Department of Anesthesiology, First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, Jiangxi Province, China) ,  Zhang Da-Ying (Department of Pain Management, First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, Jiangxi Province, China)
資料名： Journal of Molecular Neuroscience  (Journal of Molecular Neuroscience)
巻： 72  号： 3  ページ： 468-481  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0336A  ISSN： 0895-8696  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 神経因性疼痛(NP)は代謝遺伝子およびマイクロRNA(miRNA)のような非コード調節遺伝子により調節される代謝過程を含む。ここでは,NP病因に関与する代謝遺伝子を調節する重要なmiRNAシグネチャを探索することを目的とした。公開データベースからNP関連データをダウンロードし,差次的遺伝子発現解析により差次的に発現したマイクロRNA(miRNA)とmRNAを同定した。miRNA標的予測を行い,特異的に発現した代謝遺伝子(DEMG)との統合を用いて,miRNA-DEMGネットワークを構築した。続いて,機能的濃縮分析と蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)分析を行い,調節ネットワークにおけるDEMGsの役割を調べた。薬物予測は,miRNA-DEMGネットワークにおけるDEMGsに基づいて実行した。合計8251の差次的に発現したmRNA(4193の上方制御と4058の下方制御),および959の差次的に発現したmiRNA(455の上方制御と504の下方制御)を同定した。さらに,標的遺伝子予測の後,22のmiRNAと113のmRNAから成るmiRNA-DEMGネットワークを構築した。ネットワークを135ノードと236エッジで構成した。ネットワーク中のDEMGsは主に代謝経路と代謝過程に富むことを見出した。全部で1200の薬剤を,差次的発現遺伝子に基づくNPに対する可能性のある治療として予測したが,170の薬剤は,miRNA-DEMGネットワークでDEMGsに対し予測された。結論として,著者らの研究は,NPにおけるmiRNA調節異常により誘導される代謝変化に対して有効な薬物を予測した。この情報は,NPの病理学的メカニズムをさらに明らかにし,NP患者に対するより多くの治療選択肢を提供する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  調節遺伝子 ,  *代謝 ,  タンパク質 ,  代謝経路 ,  遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *アンチセンスRNA ,  病因
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  *バイオインフォマティクス ,  標的遺伝子 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 神経因性疼痛 ,  代謝遺伝子 ,  miRNA-mRNAネットワーク ,  KEGG ,  生物情報学 ,  蛋白質-蛋白質相互作用解析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 神経因性疼痛 ,  RNA代謝 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  バイオインフォマティクス解析 ,  治療 ,  予測