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J-GLOBAL ID：202202229733294864   整理番号：22A1178434

複数のシス作用性ポリピリミジントラクト要素はTriticum mosaic virusの内部リボソーム侵入部位活性の協調的機構を調節する【JST・京大機械翻訳】

Multiple Cis-acting Polypyrimidine Tract Elements Regulate a Cooperative Mechanism for Triticum Mosaic Virus Internal Ribosomal Entry Site Activity

著者 (3件)： Jaramillo-Mesa Helena (Department of Plant Pathology, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, United States) ,  Fischer Emma (Department of Plant Pathology, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, United States) ,  Rakotondrafara Aurelie M. (Department of Plant Pathology, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, United States)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 864832  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： mRNAの5′非翻訳領域内の多様な要素は,主なAUGコドンでの翻訳効率に影響する。著者らは以前に,Triticumモザイクウイルス(TriMV)内部リボソーム侵入部位(IRES)要素内の優先開始部位として認識される13番目のAUGコドンから11ntスペーサ配列により分離された16ntポリピリミジンCUトラクトを有するY_16X_11-AUGモチーフのようなコアピコルナウイルスを同定した。モチーフは指定開始コドンにおける内部リボソーム着陸部位として機能することを提案した。ここでは,TriMV YX-AUGモチーフに隣接する複数のCUリッチセグメントの協調的役割を,優先開始部位での翻訳の内部開始を到達し,駆動するために曝露した。これらの補助ドメインは,正しい開始部位の近接でリボソーム容量とその送達を増強する可能性があることを提案した。これらのポリピリミジントラクトは,天然YX-AUGモチーフを置換するために位置依存的に陰窩AUGで調節でき,開始コドン選択の制御の新しい層を明らかにする。これらの観察と一致して,これらのモチーフを持つ翻訳障害TriMV IRES変異体と直接相互作用する蛋白質の質量分析は,40S及び60Sリボソーム関連蛋白質の濃縮を示し,IRES駆動翻訳を調節するポリピリミジントラクトの新しい機能を明らかにした。trans相互作用に対するこれらのRNA領域の接近性を,全TriMVリーダー配列のSHAPE分析により確認し,IRES活性を損なうためにCU管アクセシビリティを遮断するように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドの能力により支持した。これは,植物における翻訳のための複合体,マルチAUGウイルス5′UTRにおけるリボソーム動員と開始コドン選択に必要なコアモジュールドメインを定義する最初の証拠である。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  RNA【核酸】 ,  mRNA ,  コドン ,  タンパク質 ,  複合体 ,  ピコルナウイルス科 ,  *リボソーム ,  翻訳【遺伝】 ,  シグナルペプチド ,  開始コドン ,  *コムギ属
準シソーラス用語： アンチセンスオリゴヌクレオチド ,  ドメイン構造 ,  *IRES ,  ピコルナウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 内部リボソーム侵入部位 ,  YX-AUG ,  ポリピリミジントラクト ,  翻訳開始 ,  トリティキュウムモザイクウイルス ,  AUG選択 ,  40Sと60Sリボソームサブユニット

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (56件)：

• Akbergenov R., Zhanybekova S., Kryldakov R. V., Zhigailov A., Polimbetova N. S., Hohn T., et al. (2004). ARC-1, a sequence element complementary to an internal 18S rRNA segment, enhances translation efficiency in plants when present in the leader or intercistronic region of mRNAs. Nucleic Acids Res. 32, 239-247. doi: , PMID: doi: 10.1093/nar/gkh176
• Balvay L., Soto Rifo R., Ricci E. P., Decimo D., Ohlmann T. (2009). Structural and functional diversity of viral IRESes. Biochim. Biophys. Acta 1789, 542-557. doi: , PMID: doi: 10.1016/j.bbagrm.2009.07.005
• Barrett L. W., Fletcher S., Wilton S. D. (2012). Regulation of eukaryotic gene expression by the untranslated gene regions and other non-coding elements. Cell. Mol. Life Sci. 69, 3613-3634. doi: , PMID: doi: 10.1007/s00018-012-0990-9
• Deforges J., Locker N., Sargueil B. (2015). mRNAs that specifically interact with eukaryotic ribosomal subunits. Biochimie 114, 48-57. doi: , PMID: doi: 10.1016/j.biochi.2014.12.008
• Firth A. E., Brierley I. (2012). Non-canonical translation in RNA viruses. J. Gen. Virol. 93, 1385-1409. doi: , PMID: doi: 10.1099/vir.0.042499-0

タイトルに関連する用語 (6件)： 要素 ,  Triticum ,  内部リボソーム侵入部位 ,  活性 ,  協調 ,  調節