文献

J-GLOBAL ID：202202229784832605   整理番号：22A1026862

遺伝的にコードされた臭化アルキル非正準アミノ酸の新しい反応性の解明【JST・京大機械翻訳】

Uncover New Reactivity of Genetically Encoded Alkyl Bromide Non-Canonical Amino Acids

著者 (9件)： Shu Xin (1Zhejiang Provincial Key Laboratory for Cancer Molecular Cell Biology, Life Sciences Institute, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Shu Xin (2Cancer Center, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Asghar Sana (1Zhejiang Provincial Key Laboratory for Cancer Molecular Cell Biology, Life Sciences Institute, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Asghar Sana (2Cancer Center, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Yang Fan (3Department of Biophysics, Kidney Disease Center of the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Li Shang-Tong (4Glbizzia Biosciences Co., Ltd, Beijing, China) ,  Wu Haifan (5Department of Chemistry and Biochemistry, Wichita State University, Wichita, KS, United States) ,  Yang Bing (1Zhejiang Provincial Key Laboratory for Cancer Molecular Cell Biology, Life Sciences Institute, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Yang Bing (2Cancer Center, Zhejiang University, Hangzhou, China)
資料名： Frontiers in Chemistry (Web)  (Frontiers in Chemistry (Web))
巻： 10  ページ： 815991  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7065A  ISSN： 2296-2646  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 求電子部位を有する遺伝的にコードされた非標準アミノ酸(ncAA)は,in vitroおよびin vivoの両方で蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)を研究するための優れたツールである。一連の臭化アルキルベースのncAAを含むこれらのncAAは,主に蛋白質-蛋白質架橋を形成するためにシステイン残基を標的とする。リジンとチロシン残基に対するいくつかの反応性が報告されているが,広範囲の求核アミノ酸に対するそれらの反応性の包括的理解は不足している。ここでは,最近開発したOpenUaa探索エンジンを用いて,チオレドキシンおよびアルキルブロミド系ncAA,BprYと架橋したその直接結合蛋白質に対して生成した質量分析データの詳細な解析を行った。分析は,システイン残基に加えて,BprYも広範囲の求核アミノ酸を標的にすることを示した。アフィボディ/Z蛋白質複合体とBprYのこの広い反応性を検証した。次に,SUMO2とSUMO相互作用モチーフ(SIM)間の結合界面をマッピングするためにBprYを成功裏に適用した。さらに,BprYを,SUMO2相互作用パートナーをプローブするために適用した。264のSUMO2バインダーを同定し,いくつかの検証されたSUMO2結合剤と多くの新しい結合材料を含んだ。著者らのデータは,BprYがシステイン残基なしでも蛋白質-蛋白質相互作用界面をプローブするのに効果的に使用できることを示し,それはPPIs研究におけるBprYの力を大きく拡大した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 界面 ,  質量分析 ,  相互作用 ,  架橋【高分子】 ,  *反応性 ,  *遺伝 ,  タンパク質 ,  アミノ酸残基 ,  チオレドキシン ,  タンパク質複合体 ,  in vitro実験 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  SUMO ,  システイン残基 ,  チロシン残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 蛋白質-蛋白質相互作用 ,  遺伝コード展開 ,  非正準アミノ酸 ,  化学的架橋 ,  とSUMOインタラクトーム

分類 (4件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

物質索引 (1件)： リジン

引用文献 (61件)：

• BaderG. D., HogueC. W. (2003). An Automated Method for Finding Molecular Complexes in Large Protein Interaction Networks. BMC Bioinformatics 4, 2. doi: 10.1186/1471-2105-4-2
• BouchennaJ., SénéchalM., DrobecqH., Stankovic-ValentinN., VicogneJ., MelnykO. (2019). The Role of the Conserved SUMO-2/3 Cysteine Residue on Domain Structure Investigated Using Protein Chemical Synthesis. Bioconjug. Chem. 30 (10), 2684-2696. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.9b00598
• BrüninghoffK., AustA., TaupitzK. F., WulffS., DörnerW., MootzH. D. (2020). Identification of SUMO Binding Proteins Enriched after Covalent Photo-Cross-Linking. ACS Chem. Biol. 15 (9), 2406-2414. doi: 10.1021/acschembio.0c00609
• ButlandG., Peregrín-AlvarezJ. M., LiJ., YangW., YangX., CanadienV., et al (2005). Interaction Network Containing Conserved and Essential Protein Complexes in Escherichia coli. Nature 433 (7025), 531-537. doi: 10.1038/nature03239
• ChenL.-z., LiX.-y., HuangH., XingW., GuoW., HeJ., et al (2014a). SUMO-2 Promotes mRNA Translation by Enhancing Interaction between eIF4E and eIF4G. PLoS One 9 (6), e100457. doi: 10.1371/journal.pone.0100457

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝 ,  臭 ,  アミノ酸 ,  反応性