文献

J-GLOBAL ID：202202229807785998   整理番号：22A1178557

乳癌の予後を予測する免疫グロブリン,グリコシル化および抗ウイルス遺伝子の新しいシグネチャー【JST・京大機械翻訳】

A Novel Signature Integrated of Immunoglobulin, Glycosylation and Anti-Viral Genes to Predict Prognosis for Breast Cancer

著者 (13件)： Xu Shengshan (1Department of Thoracic Surgery, Affiliated Jiangmen Hospital of Sun Yat-sen University, Jiangmen, China) ,  Xu Shengshan (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China) ,  Liu Yuchen (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China) ,  Ma Hansu (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China) ,  Fang Shuo (3Department of Oncology, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Shenzhen, China) ,  Wei Shoupeng (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China) ,  Li Xiaoping (4Department of Breast, Affiliated Jiangmen Hospital of Sun Yat-sen University, Jiangmen, China) ,  Lu Zhuming (1Department of Thoracic Surgery, Affiliated Jiangmen Hospital of Sun Yat-sen University, Jiangmen, China) ,  Zheng Youbin (5Department of Radiology, Jiangmen Wuyi Hospital of Traditional Chinese Medicine, Jiangmen, China) ,  Liu Tong (6Department of Thoracic Surgery, First Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Zhu Xiaojian (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China) ,  Xu Dongming (7Department of Neurosurgery, The Country Hospital of Qianguo, Songyuan, China) ,  Pan Yihang (2Scientific Research Center, The Seventh Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Shenzhen, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 834731  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:異常なグリコシル化は,腫瘍の発生,進行,転移および薬剤耐性と有意に関連している。乳癌の予後的価値を有するグリコシル化と関連遺伝子を同定することは必須である。目的:グリコシル化および関連遺伝子に基づく予後モデルの構築および検証を目的とし,さらに検証セットおよび外部独立コホートにおけるその予後値を検討した。【材料と方法】乳癌患者のトランスクリプトームと臨床データを,癌ゲノムアトラス(TCGA,n=1072),乳癌国際コンソーシアム(METAIRIC,n=1451),およびGSE2741(n=120)の分子的タキソノミーからダウンロードした。グリコシル化関連遺伝子は,Genecardsウェブサイトからダウンロードされた。差次的に発現したグリコシル化関連遺伝子を,腫瘍組織と隣接組織を比較することによって同定した。TCGAデータを訓練セットと検証セットにランダムに分割し,更なる分析に対して1:1の比率でセットした。グリコシル化リスクスコアリング予後モデルを単変量および多変量Cox回帰分析により構築し,続いてTCGA検証,METABRICおよびGEOデータセットの確認を行った。高および低リスク群における影響経路を同定するための遺伝子セット濃縮分析(GSEA)および遺伝子オントロジー分析を実施した。【結果】著者らは,TCGAデータベースから1072の乳癌サンプルおよびGenecardsウェブサイトから786のグリコシル化遺伝子を達成した。免疫グロブリン,グリコシル化および抗ウイルス関連遺伝子を含むシグネチャを構築し,BRCA患者を2つのリスクグループに分けた。低リスク患者は高リスク患者より良好な全生存率を有した(p<0.001)。ノモグラムをリスクスコアと臨床的特徴で構築した。時間依存ROC曲線下面積は,訓練セットで1年で0.764,3年で0.744,および5年で0.765に達した。サブグループ分析は,異なるサブグループにおける高リスク患者と低リスク患者の間のOSにおける差異を示した。さらに,リスクスコアはBRCA患者の独立した予後指標として確認され,免疫療法応答および薬物感受性と潜在的に関連していた。結論:著者らは,BRCA患者の独立予後指標である免疫グロブリン(IGHA2),グリコシル化関連(SLC35A2)および抗ウイルス遺伝子(BST2)の新規なシグネチャを同定した。リスクスコアリングモデルは,BRCAにおける予後と免疫療法の予測に使用可能であり,従って,BRCAに対抗する強力な器具を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  リスク ,  *遺伝子 ,  *免疫グロブリン ,  薬物耐性 ,  生存率 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  *グリコシル化 ,  母集団 ,  *乳房腫瘍 ,  薬剤感受性 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： リスクスコア ,  全生存率 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 乳癌 ,  遺伝子署名 ,  予後モード ,  免疫特性 ,  グリコシル化

分類 (1件)： 臨床腫よう学一般  (GE03010Y)

引用文献 (36件)：

• BasuA., RamamoorthiG., JiaY., FaughnJ., WienerD., AwshahS., et al (2019). Immunotherapy in Breast Cancer: Current Status and Future Directions. Adv. Cancer Res. 143, 295-349. doi: 10.1016/bs.acr.2019.03.006
• BianchiniG., BalkoJ. M., MayerI. A., SandersM. E., GianniL. (2016). Triple-negative Breast Cancer: Challenges and Opportunities of a Heterogeneous Disease. Nat. Rev. Clin. Oncol. 13 (11), 674-690. doi: 10.1038/nrclinonc.2016.66
• ChakrabortyA., DorsettK. A., TrummellH. Q., YangE. S., OliverP. G., BonnerJ. A., et al (2018). ST6Gal-I Sialyltransferase Promotes Chemoresistance in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma by Abrogating Gemcitabine-Mediated DNA Damage. J. Biol. Chem. 293 (3), 984-994. doi: 10.1074/jbc.M117.808584
• CuiJ., HuangW., WuB., JinJ., JingL., ShiW.-P., et al (2018). N- Glycosylation by N -acetylglucosaminyltransferase V Enhances the Interaction of CD147/basigin with Integrin β1 and Promotes HCC Metastasis. J. Pathol. 245 (1), 41-52. doi: 10.1002/path.5054
• DattaJ., FracolM., McMillanM. T., BerkE., XuS., GoodmanN., et al (2016). Association of Depressed Anti-HER2 T-Helper Type 1 Response with Recurrence in Patients with Completely Treated HER2-Positive Breast Cancer. JAMA Oncol. 2 (2), 242-246. doi: 10.1001/jamaoncol.2015.5482

タイトルに関連する用語 (7件)： 乳癌 ,  予後 ,  予測 ,  免疫グロブリン ,  グリコシル化 ,  ウイルス遺伝子 ,  シグネチャー