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J-GLOBAL ID：202202230656479899   整理番号：22A1025375

卵巣癌患者におけるピロトーシス関連lncRNA予後シグネチャの導出,包括的解析およびアッセイ検証【JST・京大機械翻訳】

Derivation, Comprehensive Analysis, and Assay Validation of a Pyroptosis-Related lncRNA Prognostic Signature in Patients With Ovarian Cancer

著者 (10件)： Cao Xueyan (1Department of Obstetrics and Gynecology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Cao Xueyan (3Medical College, Nantong University, Nantong, China) ,  Zhang Qingquan (2Department of Cardiology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Zhang Qingquan (3Medical College, Nantong University, Nantong, China) ,  Zhu Yu (1Department of Obstetrics and Gynecology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Zhu Yu (3Medical College, Nantong University, Nantong, China) ,  Huo Xiaoqing (1Department of Obstetrics and Gynecology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China) ,  Huo Xiaoqing (3Medical College, Nantong University, Nantong, China) ,  Bao Junze (3Medical College, Nantong University, Nantong, China) ,  Su Min (1Department of Obstetrics and Gynecology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 12  ページ： 780950  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ピロプトーシスは卵巣癌(OC)における長い非コードRNA(lncRNA)により調節される。したがって,OCにおけるピロプトーシス関連lncRNA(PRLs)の包括的分析は,治療戦略および生存予測を開発するために重要である。【方法】公開データベース生データに基づいて,OC患者におけるピロプトーシス関連遺伝子(PRG)の景観における突然変異を徹底的に調査した。PRLsは,ピアソン相関係数を計算することによって同定された。CoxとLASSO回帰分析をPRLsで実施し,リスク署名に関与するlncRNAをスクリーニングした。さらに,受信者動作特性(ROC)曲線,Kaplan-Meier生存分析,決定曲線分析(DCA)曲線,および検量線を用いて,臨床的利点を確認した。予後を独立して予測するためのリスク署名の能力を評価するために,臨床病理学的パラメータによるCox回帰分析に含めた。2つのノモグラムを構築し,臨床応用を容易にした。さらに,リスクシグネチャの潜在的生物学的機能を遺伝子機能アノテーションを用いて調べた。続いて,免疫関連景観とBRCA1/2変異を,多様なバイオインフォマティクスアルゴリズムを用いて異なるリスクグループで比較した。最後に,代替lncRNAsのメタ分析とin vitroアッセイを行った。結果:OCを有する合計374人の患者を訓練と検証コホート(7:3)にランダム化した。全部で250のPRLsをすべてのlncRNAから選択した。続いて,リスクシグネチャ(DICER1-AS1,MIR600HG,AC083880.1,AC109322.1,AC007991.4,IL6R-AS1,AL365361.1,およびAC022098.2)を構築し,患者生存のリスクを識別した。ROC曲線,K-M分析,DCA曲線,および検量線は,各コホートにおけるリスク署名に基づく全生存率(OS)を決定するための優れた予測性能を示した(p<0.05)。Cox回帰分析は,リスクシグネチャがOSの独立予後因子であることを示した(p<0.05)。さらに,免疫応答とBRCA1変異における有意差が,リスク署名によって識別された異なる群で同定された(p<0.05)。興味深いことに,in vitroアッセイは,代替lncRNA(DICER1-AS1)がOC細胞増殖を促進することを示した。結論:PRLリスクシグネチャは,OC患者における全生存とガイド治療を独立して予測することができた。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  回帰分析 ,  情報科学 ,  データベース ,  生物学 ,  遺伝子 ,  突然変異 ,  免疫反応 ,  細胞増殖 ,  生存率 ,  *予後 ,  母集団 ,  *卵巣腫瘍 ,  治療計画 ,  in vitro実験 ,  アノテーション
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  全生存率 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： lncRNA ,  予後シグネチャ ,  卵巣癌 ,  免疫浸潤 ,  ピロトーシス

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (46件)：

• Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer Statistics, 2019. CA Cancer J Clin (2019) 69(1):7-34. doi: doi: 10.3322/caac.21551
• Kovacs SB, Miao EA. Gasdermins: Effectors of Pyroptosis. Trends Cell Biol (2017) 27(9):673-84. doi: doi: 10.1016/j.tcb.2017.05.005
• Miao EA, Rajan JV, Aderem A. Caspase-1-Induced Pyroptotic Cell Death. Immunol Rev (2011) 243(1):206-14. doi: doi: 10.1111/j.1600-065X.2011.01044.x
• Fang Y, Tian S, Pan Y, Li W, Wang Q, Tang Y, et al. Pyroptosis: A New Frontier in Cancer. BioMed Pharmacother (2020) 121:109595. doi: doi: 10.1016/j.biopha.2019.109595
• Ruan J, Wang S, Wang J. Mechanism and Regulation of Pyroptosis-Mediated in Cancer Cell Death. Chem Biol Interact (2020) 323:109052. doi: doi: 10.1016/j.cbi.2020.109052

タイトルに関連する用語 (10件)： 卵巣 ,  癌患者 ,  ピロトーシス ,  lncRNA ,  予後 ,  シグネチャ ,  導出 ,  解析 ,  アッセイ ,  検証