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J-GLOBAL ID：202202230682129824   整理番号：22A1180608

免疫細胞シグネチャに基づく肺腺癌の免疫分類および予後遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of an Immune Classification and Prognostic Genes for Lung Adenocarcinoma Based on Immune Cell Signatures

著者 (9件)： Deng Lili (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Deng Lili (Chongqing Health Statistics Information Center, Chongqing, China) ,  Long Fei (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Wang Ting (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Dai Ling (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Chen Huajian (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Chen Huajian (Chongqing Emergency Medical Center, Chongqing University Central Hospital, School of Medicine, Chongqing University, Chongqing, China) ,  Yang Yujun (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China) ,  Xie Guoming (Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics (Chinese Ministry of Education), College of Laboratory Medicine, Chongqing Medical University, Chongqing, China)
資料名： Frontiers in Medicine (Web)  (Frontiers in Medicine (Web))
巻： 9  ページ： 855387  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7079A  ISSN： 2296-858X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:免疫療法における現在の進歩は,肺腺癌(LUAD)の不均一性による正確な腫瘍サブ分類を必要とする。本研究は,免疫細胞シグネチャに基づくLUADサブ分類システムを開発し,予後遺伝子マーカーを同定した。方法:TCGA-LUADと4つのGSEコホートの予後に関連するシグネチャを,以前に発表された184の免疫細胞シグネチャからスクリーニングし,交差した。TCGAのLUAD試料は,ConsenusclusterPlusによってクラスタ化された。免疫療法/化学療法に対する分子特性,免疫特性および感受性を比較した。LDAスコアは線形判別分析(LDA)によって確立された。共発現モジュールを,重み付け遺伝子共抑制ネットワーク分析(WGCNA)によって構築した。【結果】異なる分子および免疫特性を有する4つのLUADサブタイプを同定した。4つのサブタイプの間の予後における有意差を観察した。最悪の予後を有するIS1サブタイプは,TMB,変異遺伝子,IFNγスコア,血管新生スコアおよび免疫スコアの最も高い数を示した。20の共発現モジュールをWGCNAによって作成した。青色モジュール,スカイブルーモジュールおよびライトイエローモジュールは,LUAD予後と有意に相関した。ハブ遺伝子(CCDC90B,ARNTL2,RIPK2,SMCO2およびADAおよびNBN)は,大きな予後的意義を示し,青色モジュールから同定された。全部で8つのハブ遺伝子(NLRC3,CLEC2D,GIMAP5,CXorf65,PARP15,AKNA,ZC3H12D,およびARRDC5)を淡黄色モジュールにおいて見出した。CXorf65を除いて,他の7つの遺伝子の発現は,LUAD予後と有意に相関していた。結論:本研究は,異なる分子および免疫特性を有する4つのLUADサブタイプおよびLUADの予後に密接に関連する13の遺伝子を決定した。本知見はLUAD免疫クラスの不均一性の理解を助けることができた。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  腫瘍 ,  クラスタ化 ,  薬物療法 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  インターフェロンγ ,  *肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  血管新生
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  *肺腺癌 ,  ネットワーク解析 ,  *免疫細胞 ,  共発現 ,  線形判別分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 肺腺癌 ,  免疫細胞の特徴 ,  免疫サブタイプ ,  分子特性 ,  重み付き遺伝子相関ネットワーク解析(WGCNA) ,  予後

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

引用文献 (49件)：

• Siegel RL, Miller KD, Fuchs HE, Jemal A. Cancer statistics, 2021. CA Cancer J Clin. (2021) 71:7-33. doi: 10.3322/caac.21654
• Senosain MF, Massion PP. Intratumor heterogeneity in early lung adenocarcinoma. Front Oncol. (2020) 10:349. doi: 10.3389/fonc.2020.00349
• Iqbal MA, Arora S, Prakasam G, Calin GA, Syed MA. MicroRNA in lung cancer: role, mechanisms, pathways, and therapeutic relevance. Mol Aspects Med. (2019) 70:3-20. doi: 10.1016/j.mam.2018.07.003
• Duma N, Santana-Davila R, Molina JR. Non-small cell lung cancer: epidemiology, screening, diagnosis, and treatment. Mayo Clin Proc. (2019) 94:1623-40. doi: 10.1016/j.mayocp.2019.01.013
• Shroff GS, de Groot PM, Papadimitrakopoulou VA, Truong MT, Carter BW. Targeted therapy and immunotherapy in the treatment of non-small cell lung cancer. Radiol Clin North Am. (2018) 56:485-95. doi: 10.1016/j.rcl.2018.01.012

タイトルに関連する用語 (8件)： 免疫細胞 ,  シグネチャ ,  肺腺癌 ,  免疫 ,  分類 ,  予後 ,  遺伝子 ,  同定